python - GP 回归模型为所有测试输入预测非常相似的数字

Question

我正在使用doc2vec 嵌入氨基酸序列来尝试预测动力学速率。

我已经尝试过标准化和不标准化我的输入向量（X），但除非我标准化我的输出变量（动力学速率），否则我的 GP 模型预测所有测试输入的数字非常相似（在 4.87 和 4.9 之间）？

你应该标准化你的输出值还是我的模型有问题？

我在 Python 中使用GPy包。

这是我的代码：

#GP Regression for word vectors
def Gp_regression(Xtrain, Ytrain, Xtest, Ytest):

    kernel = GPy.kern.RBF(input_dim = 64, variance = 1, lengthscale =    1)
    m = GPy.models.GPRegression(Xtrain, Ytrain, kernel=kernel,    noise_var=1e-10)
    m.optimize_restarts(num_restarts = 10)

    Xtest = np.ndarray(shape=(1,64))
    mean = m.predict(Xtest)

return mean