1

我曾经有一个简单的 bash 脚本,用于激活 conda env 然后运行 ​​atom。然后,我可以使用hydrogen 运行python 代码,它可以自动查看myenv 中的包。

以前的 bash 脚本是这样的:

#!/bin/bash

source activate myenv && 
atom

由于 conda > 4.4 'source activate' 不再存在,我不得不将脚本修改为:

#!/bin/bash

source /home/ubuntu/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh &&
conda activate myenv &&
atom

但是,hydrogen 不再检测 myenv 并从基本 env 运行代码,这会由于基本 env 中缺少包而导致错误。

当我用 spyder 替换 atom 时,上面的脚本工作正常,并且 spyder 内核确实看到了 myenv。

知道如何解决这个问题吗?

更新1:

我又做了一些调试。似乎我的 ipykernel 没有分配给安装在激活环境中的内核,而是分配给了默认的 ipykernel。

jupyter kernelspec list当我在我的激活环境中尝试时,我得到:

python3    /home/ubuntu/.local/share/jupyter/kernels/python3

但在另一个系统上,我得到

/home/ubuntu/miniconda3/envs/myenv/share/jupyter/kernels/python3

这似乎是正确的内核。

关于如何解决这个问题的任何想法?

更新 2:

似乎解决了更新 1 中的问题。然后,我能够使用接受的答案在所需的环境中加载原子,并从该环境中的 ipykernel 运行氢气。

4

1 回答 1

1

source activate仍然像以前一样工作,尽管它不再是激活环境的首选方式。

如果您只运行一个命令,请尝试

conda run -n <envname> <command>

可能首先采购配置文件。

我没有尝试过,但一个潜在的问题是您&&在获取配置文件后使用。我假设\当您写问题时,行继续字符 ( ) 在那里丢失了。只需将命令写入单独的行,以便在bash 处理下一个命令之前加载配置文件。

于 2019-07-09T20:08:35.693 回答