c++ - Windows下编译RInside示例的问题

Question

我正在尝试在我们被迫使用 Windows 环境的工作中设置 RInside。

我的 R 安装位于c:\R\R-2.12.2中，因此带有空格的文件夹没有问题。

我已经在R中安装了Rcpp和RInside包。

我执行下载的RInside二进制文件中包含的以下 makefile Makefile.win

## -*- mode: makefile; tab-width: 8; -*-
##
## Simple Makefile
##
## TODO:
##  proper configure for non-Debian file locations,   [ Done ]
##  allow RHOME to be set for non-default R etc

## comment this out if you need a different version of R,
## and set set R_HOME accordingly as an environment variable
R_HOME :=       'cygdrive/c/R/R-2.12.2'

sources :=      $(wildcard *.cpp)
programs :=         $(sources:.cpp=)

## include headers and libraries for R
RCPPFLAGS :=        $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config --cppflags)
RLDFLAGS :=         $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config --ldflags)
RBLAS :=        $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config BLAS_LIBS)
RLAPACK :=      $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config LAPACK_LIBS)

## include headers and libraries for Rcpp interface classes
RCPPINCL :=         $(shell echo 'Rcpp:::CxxFlags()' | $(R_HOME)/bin/R --vanilla --    slave)
RCPPLIBS :=         $(shell echo 'Rcpp:::LdFlags()'  | $(R_HOME)/bin/R --vanilla --slave)

## include headers and libraries for RInside embedding classes
RINSIDEINCL :=      $(shell echo 'RInside:::CxxFlags()' | $(R_HOME)/bin/R --vanilla --slave)
RINSIDELIBS :=      $(shell echo 'RInside:::LdFlags()'  | $(R_HOME)/bin/R --vanilla --slave)

## compiler etc settings used in default make rules
CXX :=          $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config CXX)
CPPFLAGS :=         -Wall $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config CPPFLAGS)
CXXFLAGS :=         $(RCPPFLAGS) $(RCPPINCL) $(RINSIDEINCL) $(shell     $(R_HOME)/bin/R     CMD config CXXFLAGS)
LDFLAGS =       -s
LDLIBS :=       $(RLDFLAGS) $(RBLAS) $(RLAPACK) $(RINSIDELIBS) $(RCPPLIBS) 
CC :=           $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config CXX)

all :           $(programs)

clean:
        rm -vf $(programs)

用命令

make -f Makefile.win

尝试构建包含的标准示例

但是，我收到以下错误：

C:\RInside_0.2.3\RInside\examples\standard>make -f Makefile.win
make: cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: Command not found
make: cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: Command not found
make: cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: Command not found
make: cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: Command not found
cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: not found
cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: not found
cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: not found
cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: not found
make: cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: Command not found
make: cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: Command not found
make: cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: Command not found
make: cygdrive/c/R/R-2.12.2/bin/R: Command not found
Wall  -s  rinside_callbacks0.cpp        -o rinside_callbacks0
make: Wall: Command not found
make: [rinside_callbacks0] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_module_sample0.cpp        -o rinside_module_sample0
make: Wall: Command not found
make: [rinside_module_sample0] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample0.cpp        -o rinside_sample0
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample0] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample1.cpp        -o rinside_sample1
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample1] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample2.cpp        -o rinside_sample2
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample2] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample3.cpp        -o rinside_sample3
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample3] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample4.cpp        -o rinside_sample4
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample4] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample5.cpp        -o rinside_sample5
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample5] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample6.cpp        -o rinside_sample6
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample6] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample7.cpp        -o rinside_sample7
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample7] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample8.cpp        -o rinside_sample8
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample8] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_sample9.cpp        -o rinside_sample9
make: Wall: Command not found
make: [rinside_sample9] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_test0.cpp        -o rinside_test0
make: Wall: Command not found
make: [rinside_test0] Error 127 (ignored)
Wall  -s  rinside_test1.cpp        -o rinside_test1
make: Wall: Command not found
make: [rinside_test1] Error 127 (ignored)

我尝试了不同的R_HOME路径，但我质疑我找到正确路径的能力。我是 makefile 的新手，所以错误输出没有太大帮助。

希望有人有一些有价值的见解分享！

提前致谢，

基督教

score 6 · Accepted Answer

我在工作中也有类似的设置，所以我试了一下。在我指定R_LIBS_SITE. 请注意，它必须是Windows路径，而不是 Cygwin 路径！

export R_LIBS_SITE=c:/R/site-library

score 6 · Accepted Answer

您在这里似乎有两个明显的问题：

你$PATH可能已经离开了，或者正如乔希暗示的那样，你的$R_HOME任务是错误的。如果make确实是来自 Rtools 的二进制文件，并且您分配的路径正确，则构建成功。这是在 Windows 上构建 R 包的一般规则：非常勤奋地遵循手册，它将起作用。
RInside 在 Windows 上坏了，抱歉。它会建立，你会得到段错误。Romain 和我在文档中明确说明了这一点。

由于 Romain 和我几乎分别在 OS X 和 Linux 上工作，因此我们将不胜感激调试帮助。它应该是可行的，但它可能需要一些认真的意愿来了解 R 的内部结构，因为内存子系统中的某些东西会崩溃。它显然不在名称中带有 X 的操作系统上。

2011 年 12 月 8 日更新：截至今日，在 CRAN 上的 RInside 0.2.5 恢复了 Windows 功能——使用 James 在其他评论中指出的修复。

score 4 · Accepted Answer

我今天花了一点时间查看 Windows 版本的 RInside 的错误。我相信我已经发现了如下错误：

在 RInside::initialize(……) 中填充了 structRStart 结构，但是现在需要在窗口的情况下填充额外的字段，如 R\src\gnuwin32\embedded.c 中的 Rf_initEmbeddedR() 所示。

Rp->rhome = RHome;
Rp->home = getRUser();
Rp->CharacterMode = LinkDLL;
Rp->ReadConsole = myReadConsole;
Rp->WriteConsole = myWriteConsole;
Rp->CallBack = myCallBack;
Rp->ShowMessage = askok;
Rp->YesNoCancel = askyesnocancel;
Rp->Busy = myBusy;

为了提供有效的回调，在 RInside.cpp 中需要等效的分配。

c++ - Windows下编译RInside示例的问题

3 回答 3

Related

Reference