bash - BASH 脚本中程序标志的复制和扩展

Question

我正在使用一个组合单个文件的程序，并且我正在将该程序合并到我正在组合的 BASH 管道中。该程序需要为每个文件设置一个标志，如下所示：

program -V file_1.g.vcf -V file_2.g.vcf -V file_3.g.vcf -O combined_output.g.vcf

为了允许脚本处理任意数量的样本，我想读取目录中的各个文件名，并在“-V”标志之后展开每个文件的路径。

我尝试使用以下内容将文件路径添加到变量中，但没有成功进行适当的扩展：

GVCFS=('-V' `ls gvcfs/*.g.vcf`)

任何帮助是极大的赞赏！

Answer 1

您可以通过使用循环来使用以下选项填充数组来做到这一点：

options=()
for file in gvcfs/*.g.vcf; do    # Don't parse ls, just use a direct wildcard expression
    options+=(-V "${file##*/}")    # If you want the full path, leave off ##*/
done

program "${options[@]}" -O combined_output.g.vcf

Answer 2

printf可以帮忙：

options=( $(printf -- "-V %s " gvcfs/*.g.vcf ) )

虽然这不会优雅地处理文件名中的空格。还要考虑realpath生成绝对文件名。