3

我正在尝试将我的 UpsetR 图中的集合名称标签（使用 Upset 函数）更改为多个单词的字符串。我想让集合标签显示为“A 描述”、“B 描述”、“C 描述”，而不是“A”、“B”、“C”作为集合标签。我不希望单词之间有句点或下划线。

test <- upset(grouped_hot,
sets= c("A Description", "B Description","C Description", "N Description"),
nintersects = 8, 
mb.ratio = c(0.6, 0.4),
sets.x.label = "Number of Patients",
sets.bar.color =  "#56B4E9", 
mainbar.y.label = "Number of Patients",
order.by = "freq", 
empty.intersections = "on", 
keep.order = FALSE,
 scale.sets = "identity", 
att.pos = "top", 
text.scale = c(2.5,2.5,2,1.5,2.5,2.5))

实际结果是我的图像上的集合被标记为 A.Description、B.Description 和 C.Description。但是，我不想要单词之间的句点，而是想要一个空格。仅出于情节目的而更改设置名称标签名称的任何想法？谢谢！

4

1 回答 1

1

我以稍微不同的方式使用不满意功能，但如果您能够重新格式化/重新排序输入数据，它可能会对您有所帮助。

这里：

##make input list
listInput = list(data.list1,
                 data.list2,
                 data.list3)
##rename list
names(listInput) = c("Name 1", "Name 2", "Name 3")

#make diagram
upset(fromList(listInput), order.by = "freq", #input, descending order  
      mainbar.y.label = "Number of common genes", #y axis
      sets.x.label = "Number of genes \nin the dataset", #x axis small plot
      main.bar.color = "black",
      sets.bar.color = "black",
      mainbar.y.max = 10 #y axis adjustment
        )

它将集合名称读取为名称 1、名称 2 和名称 3。

希望它有帮助:) 安娜

于 2019-05-27T07:23:02.430 回答