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我想用 datashader + holoviews 绘制一个大图，但我遇到了一个错误。
一些小而可重复的东西是：

import holoviews as hv
import pandas as pd
import dask.dataframe as dd
from holoviews.operation.datashader import (
    datashade, aggregate, dynspread,
    bundle_graph, split_dataframe,  regrid
)
from holoviews.element.graphs import layout_nodes
from datashader.layout import forceatlas2_layout, random_layout

hv.extension('bokeh')

targets = [4, 4, 4, 4, 4]
sources = [3, 1, 2, 3, 4]
df = pd.DataFrame({'source': sources, 'target': targets})
edges_df = dd.from_pandas(df, npartitions=3)

graph = layout_nodes(hv.Graph(edges_df), layout=forceatlas2_layout)
forceatlas = bundle_graph(graph, split=False)
pad = dict(x=(-.5, 1.3), y=(-.5, 1.3))
datashade(forceatlas, width=800, height=800) * forceatlas.nodes.redim.range(**pad)

失败了

ValueError: 没有足够的值来解包（预期 3，得到 0）
---> 17 graph = layout_nodes(hv.Graph(edges_df), layout=forceatlas2_layout)

但是，设置targets = [1, 1, 1, 1, 1]我得到一个情节。
使用“故障” targets，如果我使用random_layout而不是 forceatlas2，我也会得到一个情节。

我很困惑！为什么我会收到该错误以及如何摆脱它？我正在使用数据着色器 0.7.0。

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1 回答 1

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尝试将有问题的行替换为
graph = layout_nodes(hv.Graph(edges_df), layout=forceatlas2_layout, kwargs = {'id': 'index'})

这应该允许处理库内部。

于 2019-04-16T14:38:08.503 回答