r - 加载 .rda 文件并遍历其对象

Question

我加载了一个 rda 文件，它基本上是一个数据框列表。我如何迭代对象？

>load(data)
>attach(data)
 The following objects are masked _by_ .GlobalEnv:

GSE109597, GSE18897, GSE32575, GSE53232, GSE55205, GSE69039,
GSE83223, GSE87493, GSE98895
> R » objects()
[1] "GSE109597" "GSE18897"  "GSE32575"  "GSE53232"  "GSE55205"  "GSE69039" 
[7] "GSE83223"  "GSE87493"  "GSE98895" 

Answer 1

两个想法：

1. 显式加载到一个新的空环境中，然后在那里处理它们：

   e <- new.env(parent = emptyenv())
   load(filename, envir = e)
   out <- eapply(e, function(x) {
     # do something with x
   })
   

2. 从?load，它返回一个“创建的对象名称的字符向量，不可见”。如果您捕获（不可见）矢量，您应该能够执行以下操作：

   nms <- load(data)
   for (nm in nms) {
     x <- get(nm)
     # do something with x
     # optional, save it back with assign(nm, x)
   }
   # or to capture all data into a list (similar to bullet 1 above)
   out <- lapply(lapply(nms, get), function(x) {
     # do something with x
   })
   

我更喜欢第一个（基于环境的）解决方案，原因如下：

• 它永远不会覆盖任何东西.GlobalEnv......在经历了一些难以重现的问题之后，这对我来说意义重大
• 它鼓励一种类似列表的做事方式，当.rda文件中的大多数或所有对象都是相同的“事物”（例如，框架、列表）并且我计划对它们中的每一个执行相同的操作时，更重要的是
• 如果对数据来源​​有任何疑问，它不会弄乱我的任何命名空间或全局环境