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我正在尝试按顺序导入 3D 图像并将识别标签链接到每个文件夹。目前我有代码为 dicom 文件执行此操作，但我也在尝试使用 .tiff 图像文件：

data_dir = "\\tiff\\"
patients =  os.listdir(data_dir)
labels_df = pd.read_csv('\\tiff_labels.csv', index_col = 0)
IMG_PX_SIZE = 50
HM_SLICES = 20
def process_data(patient, labels_df, image_px_size = 50, hm_slices = 20, visualize = False):
    label = labels_df.at[patient, 'label']
    path = data_dir + patient
    slices = [pydicom.read_file(path + '/' + s, force = True) for s in os.listdir(path)]
    slices.sort(key = lambda x: int(x.ImagePositionPatient[2]))

我尝试将第 9 行和第 10 行更改为：

slices = [cv2.imread(path + '/' + s) for s in os.listdir(path)]
slices.sort()

我发现的问题在第 10 行：key = lambda x: int(x.ImagePositionPatient[2])。ImagePositionPatient 是 dicoms 独有的东西，找不到用另一种方式对图像进行排序的方法。

我得到错误：

Traceback (most recent call last):
  File "preprocessing_data.py", line 83, in <module>
    image_data, label = process_data(patient, labels_df, image_px_size = IMG_PX_SIZE, hm_slices = HM_SLICES)
  File "preprocessing_data.py", line 28, in process_data
    slices.sort()
ValueError: The truth value of an array with more than one element is ambiguous. Use a.any() or a.all()
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2 回答 2

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如果您尝试对 numpy 数组列表进行排序，请尝试以下操作：

slices.sort(key=len)
于 2019-03-19T01:13:51.390 回答
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我看到的问题是

slices = [cv2.imread(path + '/' + s) for s in os.listdir(path)]

仅使用图像数据创建数组列表，没有可用于排序的有意义的信息。如果你想按文件名排序，你可以这样做：

slices = [[s,cv2.imread(path + '/' + s)] for s in os.listdir(path)]

它为您读取的每个文件创建一个包含 2 个条目的列表，第一个条目是文件名，第二个条目是图像数据。然后slices.sort()开箱即用。但是您必须索引两个列表才能获取图像数据。例如，要访问第 5 张图像，将是slices[5][1].

于 2019-03-19T01:16:44.703 回答