r - 导入 -100 作为 NA

Question

我正在处理一个巨大的 Excel 文件（数千列），研究人员使用了各种方法对 NA 进行编码，包括 -100。我将如何导入这个？我试过了

library("openxlsx")
df <- read.xlsx("file.xlsx", sheet = 1, colNames = TRUE, detectDates=TRUE, skipEmptyRows=TRUE, na.strings=c("NA", "N/A", "-100", "-"))

但是，-100 仍然显示为 -100，而不是 NA。

Answer 1

这似乎是openxlsx::read.xlsx. 我创建了一个.xlsx包含两列的小文档：

然后尝试用read.xlsx. 这个na.strings论点似乎不太奏效。"N/A"它用两个值（不需要）省略最后一行，并保持"-99"原样而不是NA根据需要替换它们：

library(openxlsx)
read.xlsx("test.xlsx", na.strings = c("N/A", "-99"))
#   num  char
# 1   1 hello
# 2 -99   -99
# 3   3     3

# for comparison, without na.strings
read.xlsx("test.xlsx")
#   num  char
# 1   1 hello
# 2 -99   -99
# 3   3     3
# 4 N/A   N/A

该readxl软件包做得更好：

library(readxl)
read_excel("test.xlsx", na = "-99")
# # A tibble: 4 x 2
#     num char 
#   <dbl> <chr>
# 1     1 hello
# 2    NA NA   
# 3     3 3    
# 4    NA NA   

这是使用新安装的openxlsx4.1.0readxl版和 1.2.0 版（当前版本为 1.3.0）。

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openxlsxgithub 页面有一个关于na.strings. 我添加了这个例子。您可以在此处跟踪/评论该问题。