linux - 如何提取没有扩展名的文件名并使用提取的名称更改同一文件中的标题？

Question

我有大约 30 个 VCF 文件，文件名为ID_001.new.vcf. 我只想从文件名中提取“ID_001”部分，并在给出“Sample1”的 VCF 文件的标题行中更改它：

#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT Sample1

所以结果看起来像：

#CHROM  POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  ID_001

我该怎么做？

我曾尝试echo在 bash 中使用并从文件名中提取 ID，但我无法对其进行迭代以在文件内进行更改。

谢谢你的帮助。

Answer 1

您可以使用以下内容：

for file in *.vcf 
do 
   name=$(basename -- "$file" .new.vcf) 
   sed -i "s/Sample1/$name/g" "$file" 
done