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我希望c("a","b","c")在条件下在六个位置内置换(或组合)以始终具有交替元素的序列,例如abcbab.

排列很容易得到:

abc<-c("a","b","c")
permutations(n=3,r=6,v=abc,repeats.allowed=T)

我认为使用 gtools 是不可能做到这一点的,而且我一直在尝试为此设计一个函数——即使我认为它可能已经存在。

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2 回答 2

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由于您正在寻找排列,expand.grid因此可以与permutations. 但是由于您不想要相似的邻居,我们可以大大缩短它的维度。我认为这是合法的随机方式!

前面:

r <- replicate(6, seq_len(length(abc)-1), simplify=FALSE)
r[[1]] <- c(r[[1]], length(abc))
m <- t(apply(do.call(expand.grid, r), 1, cumsum) %% length(abc) + 1)
m[] <- abc[m]
dim(m)
# [1] 96  6
head(as.data.frame(cbind(m, apply(m, 1, paste, collapse = ""))))
#   Var1 Var2 Var3 Var4 Var5 Var6     V7
# 1    b    c    a    b    c    a bcabca
# 2    c    a    b    c    a    b cabcab
# 3    a    b    c    a    b    c abcabc
# 4    b    a    b    c    a    b babcab
# 5    c    b    c    a    b    c cbcabc
# 6    a    c    a    b    c    a acabca

演练:

  • 因为你想要它的所有回收排列,我们可以使用gtools::permutations,或者我们可以使用expand.grid......我会使用后者,我不知道它是否更快,但它确实是我需要的捷径(稍后更多)
  • 在处理这样的约束时,我喜欢扩展值向量的索引
  • 但是,由于我们不希望邻居相同,所以我认为不是每行值都是直接索引,而是我们cumsum;通过使用它,我们可以控制累积和重新达到相同值的能力......通过从可能值列表中删除0length(abc),我们消除了(a)永远不会保持不变的可能性,以及(b)实际上永远不会增加一个向量长度(重复相同的值);作为演练:

    head(expand.grid(1:3, 1:2, 1:2, 1:2, 1:2, 1:2), n = 6)
    #   Var1 Var2 Var3 Var4 Var5 Var6
    # 1    1    1    1    1    1    1
    # 2    2    1    1    1    1    1
    # 3    3    1    1    1    1    1
    # 4    1    2    1    1    1    1
    # 5    2    2    1    1    1    1
    # 6    3    2    1    1    1    1
    

    由于第一个值可以是所有三个值,因此它是1:3,但每个附加值都应与它相距 1 或 2。

    head(t(apply(expand.grid(1:3, 1:2, 1:2, 1:2, 1:2, 1:2), 1, cumsum)), n = 6)
    #      Var1 Var2 Var3 Var4 Var5 Var6
    # [1,]    1    2    3    4    5    6
    # [2,]    2    3    4    5    6    7
    # [3,]    3    4    5    6    7    8
    # [4,]    1    3    4    5    6    7
    # [5,]    2    4    5    6    7    8
    # [6,]    3    5    6    7    8    9
    

    好吧,这似乎没什么用(因为它超出了向量的长度),所以我们可以调用模运算符和移位(因为模返回从 0 开始,我们希望从 1 开始):

    head(t(apply(expand.grid(1:3, 1:2, 1:2, 1:2, 1:2, 1:2), 1, cumsum) %% 3 + 1), n = 6)
    #      Var1 Var2 Var3 Var4 Var5 Var6
    # [1,]    2    3    1    2    3    1
    # [2,]    3    1    2    3    1    2
    # [3,]    1    2    3    1    2    3
    # [4,]    2    1    2    3    1    2
    # [5,]    3    2    3    1    2    3
    # [6,]    1    3    1    2    3    1
    
  • 为了验证这是否有效,我们可以对diff每一行进行 a 并查找0

    m <- t(apply(expand.grid(1:3, 1:2, 1:2, 1:2, 1:2, 1:2), 1, cumsum) %% 3 + 1)
    any(apply(m, 1, diff) == 0)
    # [1] FALSE
    
  • 为了将其自动化为任意向量,我们借助replicate来生成可能的向量列表:

    r <- replicate(6, seq_len(length(abc)-1), simplify=FALSE)
    r[[1]] <- c(r[[1]], length(abc))
    str(r)
    # List of 6
    #  $ : int [1:3] 1 2 3
    #  $ : int [1:2] 1 2
    #  $ : int [1:2] 1 2
    #  $ : int [1:2] 1 2
    #  $ : int [1:2] 1 2
    #  $ : int [1:2] 1 2
    

    然后do.call扩展它。

  • 一个你有索引矩阵,

    head(m)
    #      Var1 Var2 Var3 Var4 Var5 Var6
    # [1,]    2    3    1    2    3    1
    # [2,]    3    1    2    3    1    2
    # [3,]    1    2    3    1    2    3
    # [4,]    2    1    2    3    1    2
    # [5,]    3    2    3    1    2    3
    # [6,]    1    3    1    2    3    1
    

    然后用向量的值替换每个索引:

    m[] <- abc[m]
    head(m)
    #      Var1 Var2 Var3 Var4 Var5 Var6
    # [1,] "b"  "c"  "a"  "b"  "c"  "a" 
    # [2,] "c"  "a"  "b"  "c"  "a"  "b" 
    # [3,] "a"  "b"  "c"  "a"  "b"  "c" 
    # [4,] "b"  "a"  "b"  "c"  "a"  "b" 
    # [5,] "c"  "b"  "c"  "a"  "b"  "c" 
    # [6,] "a"  "c"  "a"  "b"  "c"  "a" 
    
  • 然后我们cbind联合字符串(通过applypaste


表现:

library(microbenchmark)
library(dplyr)
library(tidyr)
library(stringr)

microbenchmark(
  tidy1 = {
    gtools::permutations(n = 3, r = 6, v = abc, repeats.allowed = TRUE) %>% 
      data.frame() %>% 
      unite(united, sep = "", remove = FALSE) %>%
      filter(!str_detect(united, "([a-c])\\1"))
  },
  tidy2 = {
      filter(unite(data.frame(gtools::permutations(n = 3, r = 6, v = abc, repeats.allowed = TRUE)),
                   united, sep = "", remove = FALSE),
             !str_detect(united, "([a-c])\\1"))
  },
  base = {
    r <- replicate(6, seq_len(length(abc)-1), simplify=FALSE)
    r[[1]] <- c(r[[1]], length(abc))
    m <- t(apply(do.call(expand.grid, r), 1, cumsum) %% length(abc) + 1)
    m[] <- abc[m]
  },
  times=10000
)
# Unit: microseconds
#   expr      min        lq     mean   median       uq       max neval
#  tidy1 1875.400 2028.8510 2446.751 2165.651 2456.051 12790.901 10000
#  tidy2 1745.402 1875.5015 2284.700 2000.051 2278.101 50163.901 10000
#   base  796.701  871.4015 1020.993  919.801 1021.801  7373.901 10000

我尝试了中缀(非%>%)tidy2 版本只是为了好玩,虽然我相信理论上它会更快,但我没有意识到它会减少超过 7% 的运行时间。(50163 可能是 R 垃圾收集器,而不是“真实的”。)我们为可读性/可维护性付出的代价。

于 2018-12-01T02:24:40.247 回答
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可能有更清洁的方法,但在这里你去:

abc <- letters[1:3]

library(tidyverse)

res <- gtools::permutations(n = 3, r = 6, v = abc, repeats.allowed = TRUE) %>% 
  data.frame() %>% 
  unite(united, sep = "", remove = FALSE) %>%
  filter(!str_detect(united, "([a-c])\\1"))

head(res)  

  united X1 X2 X3 X4 X5 X6
1 ababab  a  b  a  b  a  b
2 ababac  a  b  a  b  a  c
3 ababca  a  b  a  b  c  a
4 ababcb  a  b  a  b  c  b
5 abacab  a  b  a  c  a  b
6 abacac  a  b  a  c  a  c

如果你想要一个向量,你可以在上面的管道末端使用res$united或添加一个额外的步骤。%>% pull(united)

于 2018-11-30T23:43:20.283 回答