这是这个问题的后续问题:How to set .libPaths (checkpoint) on workers when running parallel computing in R
根据答案,我将以下代码(简化示例)放入名为“test1”的 R 包中:
#' @export
f <- function() {
`%dopar%` <- foreach::`%dopar%`
doFuture::registerDoFuture()
libs <- .libPaths()
res <- foreach::foreach(x = 1:2) %dopar% {
cat(sprintf("Initial Library paths used by worker (PID %d):\n", Sys.getpid()))
cat(sprintf(" - %s\n", sQuote(.libPaths()[1])))
## Use the same library paths as the master R session
.libPaths(libs)
cat(sprintf("Library paths used by worker (PID %d):\n", Sys.getpid()))
cat(sprintf(" - %s\n", sQuote(.libPaths()[1])))
x + g()
}
res
}
g <- function() {
h()
}
h <- function() {
runif(1)
}
然后我调用checkpoint::checkpoint("2018-07-24")
并将包安装到检查点库中。然后下面的代码产生了这个错误:
checkpoint::checkpoint("2018-07-24")
future::plan("multisession")
test1::f()
工作人员使用的初始库路径(PID 16880):-'C:/Programme/R-3.5.1/library'
工作人员使用的库路径(PID 16880):-'.../.checkpoint/2018-07-24/lib/x86_64-w64-mingw32/3.5.1'
工作人员使用的初始库路径(PID 3916):-'C:/Programme/R-3.5.1/library'
工作人员使用的库路径(PID 3916):-'.../.checkpoint/2018-07-24/lib/x86_64-w64-mingw32/3.5.1'
{ 中的错误:任务 1 失败 - “找不到函数“h””
test1:::g()
当我在通话中明确调用foreach
时,它可以工作。有人可以解释一下,为什么我必须在 foreach 循环中显式调用我自己的包的函数:::
?看起来g()
好像找到了,但h()
后来没有?