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我正在尝试打开一个 Granges 文件,并且我想将其存储在特定名称而不是文件名下,以便以后可以在函数和循环中使用该文件。以下工作正常,但将文件保存在名称“grs”下。

load("~/data/grs_xxx.Rdata")
> head(grs)

GRanges object with 6 ranges and 0 metadata columns:
         seqnames      ranges strand
            <Rle>   <IRanges>  <Rle>
  [1] NC_007070.3 27001-27100      *
  [2] NC_007070.3 27051-27150      *
  [3] NC_007070.3 27101-27200      *
  [4] NC_007070.3 27151-27250      *
  [5] NC_007070.3 27201-27300      *
  [6] NC_007070.3 27251-27350      *
  -------

如果我尝试分配它;

    test <- load("~/data/grs_xxx.Rdata")
> head(test)
[1] "grs"

有没有办法不影响 Granges 表?

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1 回答 1

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我无法找到解决此问题的直接方法,load()但我可以使用我发现的解决方法;

如何将对象加载到我从 R 数据文件中指定的变量名中?

用户里卡多帖子;

loadRData <- function(fileName){
#loads an RData file, and returns it
   load(fileName)
   get(ls()[ls() != "fileName"])
}
d <- loadRData("~/blah/ricardo.RData")
于 2018-10-30T16:16:53.103 回答