imagej - .nd2 到 .tif 使用斐济生物格式无窗

Question

感谢您的光临。

我正在尝试处理从 .nd2 到 .TIF 的约 50 张图像，但导出的图像不是我所期望的，我不确定出了什么问题。我的 .nd2 有两个通道，我希望最终的 .TIF 成为两个通道的图像。但是，我的代码的 .TIF 输出只是一个通道的图像。

setBatchMode(true); //Batch mode processing setting in ImageJ
for (i=0; i<list.length; i++) {
    showProgress(i+1, list.length);
    filename = list[i];
    setBatchMode(true); // prevents image windows from opening while the script is running
    run("Bio-Formats Windowless Importer", "open=[" + dir1 + filename +"] autoscale color_mode=Composite rois_import=[ROI manager] view=DataBrowser stack_order=XYCZT");

    selectWindow(filename);
    run("Stack to RGB", "slices"); // convert to RGB stack

...在这部分代码之后，我拆分 z 堆栈，找到中间，并将该切片保存为 .TIFF。

如果有任何不清楚的地方，请告诉我。再次感谢您的阅读。