我正在尝试从 MATLAB 迁移到 Python,而我在 Matlab 开发过程中经常依赖的一件事是能够通过遍历层和调用drawow来快速可视化数据立方体的切片,例如
tst = randn(1000,1000,100);
for n = 1:size(tst, 3)
imagesc(tst(:,:,n));
drawnow;
end
当我在 MATLAB 中 tic/toc 时,它显示该图形正在以大约 28fps 的速度更新。相比之下,当我尝试使用 matplotlib 的 imshow() 命令执行此操作时,即使使用 set_data(),它也会以蜗牛的速度运行。
import matplotlib as mp
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
tmp = np.random.random((1000,1000,100))
myfig = plt.imshow(tmp[:,:,i], aspect='auto')
for i in np.arange(0,tmp.shape[2]):
myfig.set_data(tmp[:,:,i])
mp.pyplot.title(str(i))
mp.pyplot.pause(0.001)
在我的计算机上,默认(非常小)比例以大约 16 fps 的速度运行,如果我将其调整为更大且与 matlab 图相同的大小,它会减慢到大约 5 fps。从一些较旧的线程中,我看到了使用 glumpy 的建议,我将它与所有适当的包和库(glfw 等)一起安装,包本身工作正常,但它不再支持中建议的简单图像可视化以前的线程。
然后我下载了 vispy,我可以使用该线程中的代码作为模板使用它制作图像:
import sys
from vispy import scene
from vispy import app
import numpy as np
canvas = scene.SceneCanvas(keys='interactive')
canvas.size = 800, 600
canvas.show()
# Set up a viewbox to display the image with interactive pan/zoom
view = canvas.central_widget.add_view()
# Create the image
img_data = np.random.random((800,800, 3))
image = scene.visuals.Image(img_data, parent=view.scene)
view.camera.set_range()
# unsuccessfully tacked on the end to see if I can modify the figure.
# Does nothing.
img_data_new = np.zeros((800,800, 3))
image = scene.visuals.Image(img_data_new, parent=view.scene)
view.camera.set_range()
Vispy 看起来非常快,看起来它可以让我到达那里,但是如何用新数据更新画布?谢谢,