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我已经为 R 构建了一个包，它将 R 包装在一些 Java 类周围。在我的开发笔记本电脑（Ubuntu）上，这个包可以正常加载并且运行良好。在另外两台机器（一台 Ubuntu，一台 Debian）上，我尝试使用这个包并且.jpackage()调用没有设置类路径。

这三台机器都在运行 R 2.12.1 和 rJava .8-8，我相信它们是最新的。

整个包都在 Google Code 上，但这里是 zzz.R 文件的内容，它可以在一台机器上设置类路径，但不能在其他机器上设置：

##' @import rJava
.onLoad <- function(lib, pkg) {
    pathToSdk <- paste(system.file(package = "GSRadR") , "/gsrad_sample/lib/", sep="")

    jarPaths <- c(paste(pathToSdk, "clima_core-1.0.0.jar", sep=""),
                  paste(pathToSdk, "clima_GSRAD-1.0.0.jar", sep=""),
                  paste(pathToSdk, "colt-1.0.jar", sep=""),
                  paste(pathToSdk, "commons-lang-2.0.jar", sep=""),
                  paste(pathToSdk, "junit-3.8.1.jar", sep=""),
                  paste(pathToSdk, "log4j-1.2.8.jar", sep=""),
                  paste(pathToSdk, "xqore.jar", sep="")
                  )    
    .jpackage(pkg, morePaths=jarPaths)
    attach( javaImport( c("java.lang", "java.io")))
    packageStartupMessage( paste( "GSRadR loaded. The classpath is: ", paste(.jclassPath(), collapse=" " ) ) )        
}

在我的笔记本电脑上，这将返回以下内容：

> require(GSRadR)
Loading required package: GSRadR
Loading required package: rJava
GSRadR loaded. The classpath is:  /home/jal/R/library/rJava/java /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_core-1.0.0.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_GSRAD-1.0.0.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/colt-1.0.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/commons-lang-2.0.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/junit-3.8.1.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/log4j-1.2.8.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/xqore.jar

但在我的其他机器上它只返回：

> require(GSRadR)
Loading required package: GSRadR
Loading required package: rJava
GSRadR loaded. The classpath is:  /usr/lib/R/site-library/rJava/java

关于可能导致 .jpackage() 调用在不同机器上以不同方式工作的任何提示？我之前使用 rJava 构建了包，并且对.onLoad()函数使用了相同的模板，没有任何问题。

编辑

因此，在其中一台不起作用的机器上，我尝试以“非包”方式简单地添加类路径的路径。那失败了：

> .jaddClassPath("/home/jal/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_core-1.0.0.jar")
> .jclassPath()
[1] "/usr/lib/R/site-library/rJava/java"

嗯......所以我不能在类路径中添加任何东西。但为什么？

编辑二

当我将自定义库加载到其中一台无法正常工作的机器上时，我使用了一个临时库位置，如下所示：

install.packages("/tmp/GSRadR_0.01.tar.gz", lib=/my/path)

然后像这样加载库：

require(GARadR, lib=/my/path)

我通过反复试验发现，如果我移除lib=钻头，它会正常工作。那么，为什么将使用 rJava 的 R 包加载到自定义库位置会阻止.jaddClassPath()函数工作呢？

我也许可以解决这个问题，但我很想知道是什么导致了这种奇怪的（至少对我而言）行为。

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我怀疑第一次编辑中的目录或文件不存在：/home/jal/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_core-1.0.0.jar. （另外，您确定要添加该特定文件或目录吗？）

试试file.info("/home/jal/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_core-1.0.0.jar")。

就我而言，我试过.jaddClassPath("/willy/wonka")了，但没有用。但是当我尝试时.jaddClassPath("/home/voldemort")，它起作用了。（让 Java 成为你的魂器。）

于 2011-07-29T02:36:34.797 回答