niftynet - 我正在努力实现多通道图像

Question

我正在尝试在一组 3D MRI 体积上训练 vnet 架构，并且我想尝试为每个图像添加一个具有不同回波时间的通道，从而有效地使其成为 4D。我看到 niftynet 允许 4D 图像输入，但我收到错误消息，指出 vnet 不允许包含时间维度的输入。什么是我更改源代码的最佳位置，或者我应该如何组合渠道？

谢谢

Answer 1

NiftyNet 遵循nifti1 格式，其中前三个轴用于空间维度，第四轴用于时间，第五轴用于多模态值。因此，使用多通道输入的一种方法是创建带有 .nii 数组的 .nii 文件[Height, Width, Depth, 1, Channels]。