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TL;DR :-) 获取 https url 在 python 和 R 中都有效,但在从 R 中运行 python 代码时无效。


在 RKeras 包的文档中运行一些代码时,我反复遇到致命错误:"unknown url type: https"问题源于用 Python 实现的 Keras。

我深入研究了这个问题,发现这是在 Keras 调用urlretrieve模块six中的函数以从 https url 检索数据时发生的。

然后我在 iPython 中测试了代码,发现它运行良好。

<!-- language: lang-python -->
from six.moves.urllib.request import urlretrieve
urlretrieve(url="https://www.google.com")

然后我尝试在 R 中做同样的事情,但它失败了

<!-- language: lang-r -->
library(reticulate)
py_run_string('from six.moves.urllib.request import urlretrieve')
py_run_string("urlretrieve(url='https://www.google.com')")

但是,同样的事情在 R 中也适用于普通的 http

<!-- language:lang-r -->
py_run_string("urlretrieve(url='http://www.google.com')")

作为记录,https 在我的 R 中使用 httr 之类的包可以正常工作。

我在这里完全超出了我的深度。会发生什么?

这是关于我的环境的一些输出

回复:

sessionInfo()
# R version 3.4.4 (2018-03-15)
# Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
# Running under: Ubuntu 16.04.4 LTS
# other attached packages:
# [1] reticulate_1.6 kerasR_0.8.0  

和 Python(从 R 看)

py_config()

version:        3.5.2 |Anaconda custom (64-bit)| 
(default, Jul  2 2016, 17:53:06)  [GCC 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-1)]

将非常感谢您的时间和精力。


编辑:R中的更多调试信息:

py_run_string("from OpenSSL import SSL")
# ImportError: /xxx/python3.5/lib-dynload/_ssl.so: undefined symbol: SSLv2_method
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目前,我正在发布针对我的特定问题的部分解决方案。这不会解决 Reticulate 和 SSL 的一般问题,但它是一个不错的临时解决方法,可以帮助任何使用KerasR 或 Keras 并发现它无法下载模型和数据库的人

Keras / KerasR 使用缓存来避免将来下载相同的对象。就我而言,它是~/.keras/

所以从控制台复制下载失败的URL,用浏览器下载对象并保存到keras的缓存目录。

cache for models : ~/.keras/models/
cache for datasets : ~/.keras/datasets/
(where ~ is my home directory)

当然,这是一种解决方法,我仍然期待有人发布适用于系统范围的适当解决方案。

于 2018-04-09T12:58:16.100 回答