我正在浏览示例(如下):这是一个二元分类示例。我想确保我的一些直觉在这里是正确的,lime
因为由于它相对较新,没有太多关于包的文档。
示例的输出
library(xgboost)
library(dplyr)
library(caret)
library(insuranceData) # example dataset https://cran.r-project.org/web/packages/insuranceData/insuranceData.pdf
library(lime) # Local Interpretable Model-Agnostic Explanations
set.seed(123)
data(dataCar)
mydb <- dataCar %>% select(clm, exposure, veh_value, veh_body,
veh_age, gender, area, agecat)
label_var <- "clm"
offset_var <- "exposure"
feature_vars <- mydb %>%
select(-one_of(c(label_var, offset_var))) %>%
colnames()
#preparing data for xgboost (one hot encoding of categorical (factor) data
myformula <- paste0( "~", paste0( feature_vars, collapse = " + ") ) %>% as.formula()
dummyFier <- caret::dummyVars(myformula, data=mydb, fullRank = TRUE)
dummyVars.df <- predict(dummyFier,newdata = mydb)
mydb_dummy <- cbind(mydb %>% select(one_of(c(label_var, offset_var))),
dummyVars.df)
rm(myformula, dummyFier, dummyVars.df)
feature_vars_dummy <- mydb_dummy %>% select(-one_of(c(label_var, offset_var))) %>% colnames()
xgbMatrix <- xgb.DMatrix(
data = mydb_dummy %>% select(feature_vars_dummy) %>% as.matrix,
label = mydb_dummy %>% pull(label_var),
missing = "NAN")
#model 2 : this works
myParam2 <- list(max.depth = 2,
eta = .01,
gamma = 0.001,
objective = 'binary:logistic',
eval_metric = "logloss")
booster2 <- xgb.train(
params = myParam2,
data = xgbMatrix,
nround = 50)
explainer <- lime(mydb_dummy %>% select(feature_vars_dummy),
model = booster2)
explanation <- explain(mydb_dummy %>% select(feature_vars_dummy) %>% head,
explainer,
n_labels = 2, ###### NOTE: I added this value, not sure if it should be '=1' or '=2' for binary classification.
n_features = 2)
plot_features(explanation)
上面的代码讨论了保险索赔,这是一个分类问题,索赔或不索赔。
问题:
的功能是什么n_labels
- 我对自己的问题有一个二进制分类,所以n_lables
对应于0
and 1
?
在此处的示例中,作者谈到了malignant
和。但是,当我在自己的分类问题上运行代码时(我确保在我绘制的数据中存在 和观察结果,但与观察结果的真实值不匹配......benign
labels
0
1
plot_features(explanation)
labels
我设置n_labels = 1
(这个情节与上面的代码不同(但仍然是一个分类问题))。
在这里,case 2
我有labels header
一个结果1
——我可以假设是一个二元分类预测吗?然而,当我输出true
二进制输出的实际结果时,我得到以下内容1 0 1 0 1 0
,我正在阅读该模型预测的case 1
分类为0
,实际上它是一个1
. case 2
预测是 a 1
,实际上是 a 0
,预测是 a ,实际上是 a ,case 3
预测是0
a ,实际上是 a等等...这是不正确的吗?顺便说一句,我使用模型进行预测。1
case 4
0
0
xgb
第二; 图中的所有0
案例(因此案例 1、3、4、5、6)都具有相似的特征......而案例 2 不同,它具有影响模型的其他变量/特征(我只绘制了来自模型(同样我不知道它们是随机绘制的还是由某些绘制的importance score
))。
我从这里引用我的分析Understading lime
在本概述中,可以清楚地看到案例 195 和 416 的行为是如何相似的,而第三个良性案例 (7) 有一个不寻常的大裸核,这在不影响最终预测的情况下降低了其良性状态(表明其值其他功能正在弥补这个奇怪的功能)。毫不奇怪,很明显,测量中的高值表示恶性肿瘤。
如果有人能给我对上述情节的某种直觉/分析,那对我来说将是朝着正确方向迈出的一大步。