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我正在学习drake来定义我的分析工作流程，但我无法将数据文件作为依赖项。

file_in()我在里面使用了这个函数，drake_plan()但它只有在我直接给出文件的路径时才有效。如果我给它一个file.path()函数或一个存储该文件路径的变量，它就不起作用。

例子：

# preparation
library(drake)

path.data <- "data"
dir.create(path.data)
write.csv(iris, file.path(path.data, "iris.csv"))

 工作计划：

# working plan
working_plan <-
  drake_plan(iris_data = read.csv(file_in("data/iris.csv")),
             strings_in_dots = "literals")
working_config <- make(working_plan)
vis_drake_graph(working_config)

该计划运行良好，文件data/iris.csv被视为依赖项

工作计划

 不工作计划：

# not working
notworking_plan <-
  drake_plan(iris_data = read.csv(file_in(file.path(path.data, "iris.csv"))),
             strings_in_dots = "literals")
notworking_config <- make(notworking_plan)
vis_drake_graph(notworking_config)

这里它试图读取文件iris.csv而不是data/iris.csv.

工作但依赖问题：

# working but "data/iris.csv" is not considered as a dependency
file.name <- file.path(path.data, "iris.csv")
notworking_plan <-
  drake_plan(iris_data = read.csv(file_in(file.name)),
             strings_in_dots = "literals")
notworking_config <- make(notworking_plan)
vis_drake_graph(notworking_config)

最后一个工作正常，但该文件不被视为依赖项，因此如果此文件更改，drake 不会重新运行计划。

不工作的德雷克计划

那么，有没有办法从变量中分辨出 Drake 文件的依赖关系？

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2 回答 2

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根据 tidyeval，如果您!!在 前面添加file.path()，它将被评估而不是引用。

此外，在新版本的 drake 中，该strings_in_dots = "literals"参数已被弃用。

library(drake)
path.data <- "data"
dir.create(path.data)
write.csv(iris, file.path(path.data, "iris.csv"))

# now working
notworking_plan <-
  drake_plan(iris_data = read.csv(file_in(!!file.path(path.data, "iris.csv"))))
notworking_plan
#> # A tibble: 1 x 2
#>   target    command                           
#>   <chr>     <expr>                            
#> 1 iris_data read.csv(file_in("data/iris.csv"))

由reprex 包（v0.2.1）于 2019 年 5 月 8 日创建

于 2019-05-08T16:56:49.823 回答
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在Github 上的开发人员回答file_in()后，未评估其中的代码，因此无法file.path在其中使用。

于 2018-03-30T13:36:40.650 回答