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我刚刚开始探索 NiftyNet。当我尝试运行autocontext_mr_ct_model_zoo.

当我运行以下命令时:

  python net_regress.py train \   -c ~/niftynet/extensions/autocontext_mr_ct/net_autocontext.ini \  
 --starting_iter 0 --max_iter 500*

我收到以下错误消息:

ValueError: Unknown keywords in config file: [error_map] -- 所有可能的选择是 ['', u'loss_border', 'output', 'image', 'weight', 'sampler', u'cuda_devices', u'num_threads ', u'num_gpus', u'model_dir', u'dataset_split_file', u'name', u'activation_function', u'batch_size', u'decay', u'reg_type', u'volume_padding_size', u'window_sampling ', u'queue_length', u'multimod_foreground_type', u'histogram_ref_file', u'norm_type', u'cutoff', u'foreground_type', u'normalisation', u'whitening', u'normalise_foreground_only', u'weight_initializer ', u'bias_initializer', u'weight_initializer_args', u'bias_initializer_args',u'优化器',u'sample_per_volume',u'rotation_angle',u'rotation_angle_x',u'rotation_angle_y',u'rotation_angle_z',u'scaling_percentage',u'random_flipping_axes',u'lr',u' loss_type',u'starting_iter',u'save_every_n',u'tensorboard_every_n',u'max_iter',u'max_checkpoints',u'validation_every_n',u'validation_max_iter',u'exclude_fraction_for_validation',u'exclude_fraction_for_inference',u' inference_iter',u'save_seg_dir',u'output_interp_order',u'border',u'csv_file',u'path_to_search',u'filename_contains',u'filename_not_contains',u'interp_order',u'pixdim',u'轴码',u'spatial_window_size']。

我不太确定我在这里搞砸了什么,欢迎任何建议。

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看起来您下载的源代码已过期,您是否使用最新版本的 NiftyNet 运行命令?

pip 包目前有点过时了,你可以通过运行获得最新的源代码

git clone https://github.com/NifTK/NiftyNet.git

# installing dependencies from the list of requirements
cd NiftyNet/
pip install -r requirements-gpu.txt

# run command from the source code folder
python net_regress.py train \
  -c ~/niftynet/extensions/autocontext_mr_ct/net_autocontext.ini \
  --starting_iter 0 --max_iter 500
于 2018-03-20T19:20:35.030 回答