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作为在进一步处理之前利用随机抽取的网络数据的一部分,我试图igraph在每次迭代开始时从包中调用几个函数。我使用的代码如下:

#define ARMA_64BIT_WORD
#include <RcppArmadillo.h>

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
using namespace Rcpp;

using arma::sp_mat;

// [[Rcpp::export]]
sp_mat adj_mat(int n, double p) {

  Environment igraph("package:igraph");
  Function game_er = igraph["erdos.renyi.game"];
  Function get_adjacency = igraph["get.adjacency"];

  List g = game_er(Named("n", n), Named("p", p));

  NumericMatrix A_m = get_adjacency(Named("g", g));

  sp_mat A = as<sp_mat>(A_m);

  return A;
}


/*** R
set.seed(20130810)
library(igraph)

adj_mat(100, 0.5)
*/

因此,虽然 C++ 编译时没有警告,但会引发以下错误:

> sourceCpp("Hooking-R-in-cpp.cpp")

> set.seed(20130810)

> library(igraph)

> adj_mat(100, 0.5)
Error in adj_mat(100, 0.5) : 
  Not compatible with requested type: [type=S4; target=double].

从错误看来,我正在将 S4 类传递给双精度类?错误在哪里?

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1 回答 1

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您在 C++ 函数的中间强加了与表示不对应的类型,因此在尝试实例化它们时遇到了运行时错误。

下面的版本有效。我不太了解igraph建议您使用什么来存储第一次退货;因为S4您可以使用dgCMatrix矩阵,但 S4 是一个不错的超集。

#include <RcppArmadillo.h>

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
using namespace Rcpp;

using arma::sp_mat;

// [[Rcpp::export]]
sp_mat adj_mat(int n, double p) {

  Environment igraph("package:igraph");
  Function game_er = igraph["erdos.renyi.game"];
  Function get_adjacency = igraph["get.adjacency"];

  SEXP g = game_er(Named("n", n), Named("p", p));

  S4 A_m = get_adjacency(Named("g", g));

  sp_mat A = as<sp_mat>(A_m);

  return A;
}

/*** R
set.seed(20130810)
library(igraph)

adj_mat(100, 0.5)
*/
于 2018-03-15T12:36:03.020 回答