python - pythonw子进程不能调用其他版本的python

Question

在我开始之前，关于我的环境的一些说明：通过 miniconda 安装的 python 2.7.14、macOS 10.13.3。

问题

我正在尝试analyze.py在 python 中编写一个数据处理管道（调用它），它调用几个不同的程序。其中一个程序，EMAN2使用它自己的 python 环境来运行（例如，位于~/EMAN2/bin/python）。在命令行中，对 eman2 的调用可能如下所示：

~/EMAN2/bin/e2buildstacks.py <args>

wheree2buildstacks.py使用文件顶部的标准类型公式指定它自己的 python 环境#!/Users/<username>/EMAN2/bin/python（注意，有很多这些不同的 .py 文件要运行，我只是使用一个名称作为示例）。

在 python 中，我为这些调用使用了 subprocess.Popen 构造。一个非常简单的例子是：

import subprocess
stacks_cmd = '/Users/<username>/EMAN2/bin/e2buildstacks.py <args>'
process = subprocess.Popen(stacks_cmd, shell=True, stdout=subprocess.PIPE)
stacks_output, stacks_error = process.communicate()

为简单起见，我替换了实际的参数和用户名。

如果这就是我正在做的一切，它工作正常。我可以从命令行运行python analyze.py，它运行 EMAN2 没有问题。

然而，这个管道被包裹在一个 GUI（基于 wxpython）中。所以我必须使用pythonw来运行我的程序。当我尝试这样做时：

pythonw analyze.py

它无法正确运行 EMAN2 脚本，出现错误：

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/<username>/EMAN2/bin/e2buildstacks.py", line 34, in <module>
    from EMAN2 import *
ImportError: No module named EMAN2

这向我表明它正在使用我的 miniconda python 而不是~/EMAN2/bin/python运行脚本。

（注意：如果有人使用 EMAN2，我可以为您提供完整的参数列表和输入文件。但请放心，这不是问题，我可以从命令行运行我正在使用的命令）

我试过的

我已经尝试了几种不同的方法来解决这个问题。最简单的是指定要在命令中使用的 python：

import subprocess
stacks_cmd = '/Users/<username>/EMAN2/bin/python /Users/<username>/EMAN2/bin/e2buildstacks.py <args>'
process = subprocess.Popen(stacks_cmd, shell=True, stdout=subprocess.PIPE)
stacks_output, stacks_error = process.communicate()

那没有用，并因同样的错误而失败。

我试过在 shell=False 模式下使用 Popen

import subprocess
stacks_cmd = ['/Users/<username>/EMAN2/bin/python', '/Users/<username>/EMAN2/bin/e2buildstacks.py', <args>]
process = subprocess.Popen(stacks_cmd, shell=False, stdout=subprocess.PIPE)
stacks_output, stacks_error = process.communicate()

或者

import subprocess
stacks_cmd = ['/Users/<username>/EMAN2/bin/e2buildstacks.py', <args>]
process = subprocess.Popen(stacks_cmd, shell=False, stdout=subprocess.PIPE)
stacks_output, stacks_error = process.communicate()

两者都失败并出现相同的错误。

我试过指定可执行文件：

import subprocess
stacks_cmd = ['/Users/<username>/EMAN2/bin/e2buildstacks.py', <args>]
process = subprocess.Popen(stacks_cmd, shell=False, stdout=subprocess.PIPE, executable='/Users/<username>/EMAN2/bin/python')
stacks_output, stacks_error = process.communicate()

这给出了一个不同的错误：

Unknown option: --
usage: /Users/<username>/EMAN2/bin/e2buildstacks.py [option] ... [-c cmd | -m mod | file | -] [arg] ...
Try `python -h' for more information.

这让我认为参数没有正确传递给脚本，而是传递给 python 本身（我可能并不真正理解可执行设置在这里的作用）。

我试过设置环境变量：

import os
my_env = os.environ.copy()
my_env['PATH'] = '/Users/<username>/EMAN2/bin:'+my_env['PATH']
my_env['PYTHONPATH'] = '/Users/<username>/EMAN2/bin'

然后在上述任何命令中将其传递给 subprocess.Popen 作为env=my_env. 这失败并出现相同的错误。

在这一点上，我几乎没有想法，希望有人能提供帮助。同样，这仅发生在pythonw，而不是python。

我读过的寻找解决方案的东西

我在 stackoverflow 上找不到与此问题完全匹配的任何内容。我看过的东西：

使用另一个版本的 python 对程序进行子处理