2

执行 .R 文件时如何获取图表?文件 ( test.r) 如下所示:

library(ggplot2)
library(ggiraph)
gg <- ggplot(data = mtcars, aes(x = mpg, y = wt, color = factor(cyl)))
gg1 <-  gg + geom_point_interactive(aes(tooltip = gear), size = 5)
ggiraph(code = print(gg1))

我正在使用以下命令运行它:

R < test.R --no-save

但什么也没有发生。如果我只是从命令行运行 R 并逐行输入代码,Firefox 会打开并显示一个非常漂亮的图形,并显示所需的鼠标悬停标签。

R version 3.2.3 (2015-12-10)
x86_64-pc-linux-gnu
4

1 回答 1

1

R生成一个临时 .html 文件,然后生成一个gvfs-open进程来查看该文件(这反过来会打开 Firefox)。当您从命令行运行脚本时,R在 Firefox 进程有机会完全加载之前退出并清理其临时文件。你可以通过这样做看到这个效果

$ R -q --interactive < test.R
> library(ggplot2)
> library(ggiraph)
> gg <- ggplot(data = mtcars, aes(x = mpg, y = wt, color = factor(cyl)))
> gg1 <-  gg + geom_point_interactive(aes(tooltip = gear), size = 5)
> ggiraph(code = print(gg1))
Save workspace image? [y/n/c]: 
gvfs-open: /tmp/RtmpPxtiZi/viewhtml3814550ff070/index.html: error opening location:
Error when getting information for file '/tmp/RtmpPxtiZi/viewhtml3814550ff070/index.html': No such file or directory

一个简单的解决方法是Sys.sleep(5)在脚本末尾添加。这会暂停R几秒钟,允许gvfs-open进程在浏览器窗口中完成打开临时文件,然后R退出并自行清理。

请注意,在 之后退出时R仍会删除临时文件,但 Firefox 将已经在内存中缓存。index.htmlSys.sleep()

编辑:另一种解决方案是将交互式绘图显式写入退出后仍然存在的 .html 文件R。您可以通过将结果存储ggiraph到变量然后将其传递给htmlwidgets::saveWidget

myplot <- ggiraph(code = print(gg1))
htmlwidgets::saveWidget( myplot, "test.html" )
browseURL( "test.html" )
于 2018-02-20T17:52:54.533 回答