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我想将文件夹名称传递给 run() 函数和 save() 函数,但它们在引号内,我不知道如何传递变量名。

我使用 imageJ 中的记录命令生成了 run() 和 save() 函数。

该程序的目的是自动化在多个文件夹上运行插件“T2 分析鼠标”的过程。任何其他推文或帮助将不胜感激。

我找到了这个在线资源https://imagej.nih.gov/ij/macros/ArgumentPassingDemo.txt但它不起作用。

我尝试了多种方法,包括/&foldername/3 T2 &filename/3 T2 /&foldername 3 T2``/&foldername3 T2 /&filename 3 T2``/&filename3 T2 以下是我编写的代码:

function makeT2(foldername)
{
    filename = foldername;
    print(filename);
    run("T2 Analysis mouse", "select=[/Users/Vineeth/Desktop/New stuff Feb 5/&filename 3 T2] 
        image=[32-bit Signed] width=256 height=128 offset=0 number=902 gap=0 little-endian");
    run("Save", "save=[/Users/Vineeth/Desktop/New stuff Feb 5/&foldername3 T2/T2map.tif]");
    close();
}

folders = getFileList("/Users/Vineeth/Desktop/New stuff Feb 5/");

for( i = 0; i < folders.length; i++)
{
  print(folders[i]);
  file = getFileList("/Users/Vineeth/Desktop/New stuff Feb 5/" + folders[i]);
  for( j = 0; j < file.length; j++)
  {
    if(file[j] == "3 T2/")
    {
      print("made t2 for  " + folders[i] + file[j]);
      makeT2(folders[i]);

    }
  }
}

各种print()功能用于测试代码,并且代码大部分适用于 makeT2 功能。

这是错误:

java.lang.NullPointerException
at T2_Analysis_mouse.getImage(T2_Analysis_mouse.java:183)
at T2_Analysis_mouse.run(T2_Analysis_mouse.java:56)
at ij.IJ.runUserPlugIn(IJ.java:183)
at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java:150)
at ij.Executer.runCommand(Executer.java:124)
at ij.Executer.run(Executer.java:61)
at ij.IJ.run(IJ.java:249)
at ij.macro.Functions.doRun(Functions.java:561)
at ij.macro.Functions.doFunction(Functions.java:79)
at ij.macro.Interpreter.doStatement(Interpreter.java:203)
at ij.macro.Interpreter.doBlock(Interpreter.java:518)
at ij.macro.Interpreter.runUserFunction(Interpreter.java:278)
at ij.macro.Interpreter.doStatement(Interpreter.java:206)
at ij.macro.Interpreter.doBlock(Interpreter.java:518)
at ij.macro.Interpreter.doStatement(Interpreter.java:239)
at ij.macro.Interpreter.doIf(Interpreter.java:852)
at ij.macro.Interpreter.doStatement(Interpreter.java:215)
at ij.macro.Interpreter.doBlock(Interpreter.java:518)
at ij.macro.Interpreter.doStatement(Interpreter.java:239)
at ij.macro.Interpreter.doFor(Interpreter.java:464)
at ij.macro.Interpreter.doStatement(Interpreter.java:221)
at ij.macro.Interpreter.doBlock(Interpreter.java:518)
at ij.macro.Interpreter.doStatement(Interpreter.java:239)
at ij.macro.Interpreter.doFor(Interpreter.java:464)
at ij.macro.Interpreter.doStatement(Interpreter.java:221)
at ij.macro.Interpreter.doStatements(Interpreter.java:191)
at ij.macro.Interpreter.run(Interpreter.java:102)
at ij.macro.Interpreter.run(Interpreter.java:72)
at ij.macro.MacroRunner.run(MacroRunner.java:124)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:695)

这是运行程序后的日志:

LeeMouseOld_30Jan18.LH1/
made t2 for  LeeMouseOld_30Jan18.LH1/3 T2/
LeeMouseOld_30Jan18.LH1/
Please choose a directory where the T1 or T2 folder is the last item in the path (i.e. 5_t1 or 6_t2)
Directory return for General T folder: /Users/Vineeth/Desktop/New stuff Feb 5/&filename 3 T2/
Please adjust import settings to:
Image type: 32-bit signed
Width: 128 pixels
Height: 256 pixels
Number of images: 50 images
Check Little-endian byte order

如您所见&filename,保持不变,但我希望变量filename中的数据位于其位置。

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使用字符串连接

run("T2 Analysis mouse", "select=[/Users/Vineeth/Desktop/New stuff Feb 5/" + filename + " 3 T2] 
        image=[32-bit Signed] width=256 height=128 offset=0 number=902 gap=0 little-endian");
run("Save", "save=[/Users/Vineeth/Desktop/New stuff Feb 5/" + foldername + "3 T2/T2map.tif]");

请参阅宏功能文档(重点添加):

运行(“命令”[,“选项”])

执行 ImageJ 菜单命令。可选的第二个参数包含自动输入对话框的值(必须是 GenericDialog 或 OpenDialog)。使用命令记录器(插件>宏>记录)生成 run() 函数调用。使用字符串连接将变量作为参数传递。对于 ImageJ 1.43 及更高版本,可以通过在变量名称中添加“&”来传递变量,而无需使用字符串连接。例如,请参阅 ArgumentPassingDemo 宏。

提到的快捷语法 with在选项字符串中的&方括号之间不起作用。[]

ImageJ 论坛上的一些问题也讨论了这一点。

于 2018-02-13T08:50:23.687 回答