r - 在 R 中，素食者的 CCA 是否存在“拟合优度”值，类似于 NMDS 的“压力”值？

Question

我想知道是否有一种方法可以从纯素 cca 对象中提取类似于 metaMDS“压力”值的东西？我已经尝试过 goodness.cca 函数及其亲属

( http://cc.oulu.fi/~jarioksa/softhelp/vegan/html/goodness.cca.html )

他们告诉我每个样本的统计数据，但我对将多维系统减少到二维的整体拟合优度感兴趣（如果存在类似的东西，因为它使用不同的计算）。如果可能的话，我想继续吃素食，尽管我在这里找到了这个链接：

（R中CCA的拟合优度）

非常感谢

RJ

Answer 1

它被称为特征值。之前有人抱怨说 NMDS 没有特征值之类的东西，只有应力。数据中的总变异是所有特征值的总和，因此特征值的比例或特征值的累积总和占总数的比例是解释的。所有这些都可以用eigenvals()及其提取summary()（参见他们的帮助?eigenvals）。轴的重要性测试可通过其anova.cca()功能获得（查看其文档以获取参考）。

您提到的网页是关于另一种方法，典型相关。在素食主义者中，我们CCorA通过排列测试来实现这一点。只需选择您的方法，然后找到您的工具。