为了更好地解释：
我有一个将文件上传到远程开发服务器的 netbeans 项目。
我正在从事的项目非常适合开源，因此我创建了一个新的 github 存储库。有很多配置文件和其他花絮（如 .htaccess 文件等）我不想包含在 repo 中，所以我只是将我想要的文件复制到一个新目录中，在那里创建了一个 git repo，我一直在使用它来将文件推送到 github。
每当我在 netbeans 中完成一些新的开发时，我必须将新的或编辑的文件复制到 repo 目录，提交更改，最后推送到 github。
我现在意识到我可以使用 .gitignore 文件（git 对我来说是新的！）。因此，我认为忽略麻烦的文件并从我正在工作的同一目录提交更改会更明智/更快，从而无需复制到另一个目录。我认为这意味着我需要将存储库克隆到我用于 netbeans 的目录中，但 git 告诉我“该目录已经存在”。
我如何去完成我所需要的？