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我应该如何在 Cython 中声明布尔掩码的类型?我真的需要申报吗?这是示例:

cpdef my_func(np.ndarray[np.double_t, ndim = 2] array_a,
            np.ndarray[np.double_t, ndim = 2] array_b,
            np.ndarray[np.double_t, ndim = 2] array_c):

    mask = ((array_a > 1) & (array_b == 2) & (array_c == 3)
    array_a[mask] = 0.
    array_b[mask] = array_c[mask]
    return array_a, array_b, array_c
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您需要“投射”np.uint8_tboolvia np.ndarray[np.uint8_t, ndim = 2, cast=True] mask = ...,即

cimport numpy as np
cpdef my_func(np.ndarray[np.double_t, ndim = 2] array_a,
            np.ndarray[np.double_t, ndim = 2] array_b,
            np.ndarray[np.double_t, ndim = 2] array_c):
    cdef np.ndarray[np.uint8_t, ndim = 2, cast=True] mask = (array_a > 1) & (arr
ay_b == 2) & (array_c == 3)
    array_a[mask] = 0.
    array_b[mask] = array_c[mask]
    return array_a, array_b, array_c

否则(没有cast=True)代码会编译,但由于类型不匹配而在运行时抛出。

但是,您根本不需要定义类型,mask可以将其用作 python 对象:会有一些性能损失,或者更准确地说,错过了通过早期类型绑定加快速度的机会,但在你的情况下,它可能并不重要。


还有一件事:我不知道你真正的代码是什么样子的,但我希望你知道,cython 根本不会加速你的例子——与 numpy 相比没有什么好处。


我们可以轻松验证 bool-np.array 每个值使用 8 位(至少在我的系统上)。这一点都不明显,例如每个值只能使用一点(很像 a bitset):

import sys
import numpy as np
a=np.random.random((10000,))
sys.getsizeof(a)
>>> 80096
sys.getsizeof(a<.5)
>>> 10096

很明显,双数组每个元素需要 8 个字节 + 86 字节开销,掩码每个元素只需要一个字节。

我们还可以看到,它False0True表示1

print (a<.5).view(np.uint8)
[1 0 1 ..., 0 0 1]

使用 cast=True可以访问底层数组中的原始字节,这是数组内存的一种 reinterpret_cast。

这里有一些信息,虽然很旧。

于 2018-01-04T07:38:56.177 回答