r - 您是否需要转换为 data.frame 才能在转换为 tibble 之前转换行名

Question

我使用输出命名矩阵的基因表达包。为了把它变成一个小标题，我总是必须先把它转换成一个data.frame，然后我才能转换行名。有没有更短的方法来做到这一点？例如：

library(tidyverse)
normalized_counts %>% 
  as.data.frame() %>%
  rownames_to_column('name') %>%
  gather(key = experiment, value = expression, -name) %>%
  as_tibble()

我更喜欢做类似的事情：

library(tidyverse)
normalized_counts %>% 
  as_tibble() %>%
  rownames_to_column('name') %>%
  gather(key = experiment, value = expression, -name)

但我不能，因为我在as_tibble步骤中丢失了行名。

Answer 1

as_tibble有一个可以使用的 rownames 参数。

library(tidyverse)
normalized_counts %>% 
  as_tibble(rownames = 'name') %>%
  gather(key = experiment, value = expression, -name)