许多科学论文，尤其是生命科学领域的论文，都以 pdf 格式发表。
我想尽可能多地在 emacs 中工作（尤其是 org 模式）。我知道 DocView 模式至少可以让我在 emacs 中查看 pdf。我怀疑它可以为我做更多的事情，但我并没有超越简单地查看基于图像的 pdf 文件渲染。
任何人都可以推荐使用 pdf 的方法，尤其是链接到文件、施加文本和在 pdf 中添加注释（在页边空白处书写的电子等价物）？
编辑：只是为了澄清我并不打算实际编辑 pdf 图像。相反，我想要 org 文件中的超链接或书签注释。我以前没有见过 DocView 的文本模式，这可能会给我我想要的，但我不知道我是否可以收藏/超链接到它。
pdf-tools允许在 emacs 中注释 pdf 文件。年轻但有前途的项目！
IMO，没有一个最佳的工作流程来管理 emacs 中的出版物。我个人只是在 org 模式下存储指向 PDF 的链接，然后在外部查看器（evince 或 Acrobat，具体取决于平台）中打开它们。有一些解决方案可以通过在 PDF 的空白处逐字书写来注释 PDF（原则上，Xournal、Jarnal 和一些专有的 Windows 软件可以做到），但我从来没有发现它们中的任何一个非常有用。当我在论文上做笔记时，我要么将它们作为折叠项存储在 org-mode 结构中，要么作为指向外部文件的链接。
其他人也提出了类似的工作流程——例如，这里有一个不错的截屏视频：http: //tincman.wordpress.com/2011/01/04/research-paper-management-with-emacs-org-mode-and -reftex/
对我来说，理想的纸张管理环境应该是与 Mendeley 接口的 org 模式。不幸的是，Mendeley 的闭源特性使得这不太可能。
DocView 模式可以在编辑和查看之间切换。但是从 doc-view-mode 的信息页面来看，PDF 不是（容易）人工可编辑的，并且文档没有谈论任何关于 PDF 注释功能的内容。
否则，Xournal 或此类工具应该是注释 PDF 的方法，除非你找到一种方法让它在 Emacs 下工作。
这不是一个真正的答案，但在 pdf-tools 中，可以使用选定的注释附加处理函数。只是有人必须实施它。
;; Toy Example for custom annotations.
(require 'pdf-annot)
(add-hook 'pdf-annot-activate-handler-functions 'pdf-org-annotation-handler)
(add-hook 'pdf-annot-print-annotation-functions 'pdf-org-print-annotation)
(setq pdf-annot-activate-created-annotations t)
(defvar pdf-org-annot-label-guid "www.orgmode.org/annotation"
"Unique annotation label used for org-annot annotations.")
(defun pdf-org-add-annotation (pos)
(interactive
(list (pdf-util-read-image-position "Click ...")))
(pdf-util-assert-pdf-buffer)
(pdf-annot-add-text-annotation
pos
"Circle"
`((color . "orange")
(label . ,pdf-org-annot-label-guid))))
(defun pdf-org-annotation-handler (a)
(when (equal (pdf-annot-get a 'label)
pdf-org-annot-label-guid)
(pop-to-buffer (get-buffer-create
(format "%s-annotations.org"
(pdf-annot-get-buffer a))))
;; Do SOMETHING.
t))
(defun pdf-org-print-annotation (a)
(when (equal (pdf-annot-get a 'label)
pdf-org-annot-label-guid)
"Org annotation, click to do SOMETHING"))
(provide 'pdf-org)