我有一个 5 列的小标题:
# A tibble: 13 x 5
sample animal RNA type fusion
<chr> <int> <chr> <chr> <list>
1 A 206 meth1 T3 <tibble [126 x 24]>
2 B 206 meth1 T5 <tibble [650 x 24]>
3 C 206 meth1 T3 <tibble [515 x 24]>
4 D 206 meth1 T5 <tibble [90 x 24]>
5 E 206 meth1 T3 <tibble [154 x 24]>
6 F 206 meth2 T5 <tibble [182 x 24]>
7 G 206 meth2 T3 <tibble [148 x 24]>
8 H 206 meth2 T5 <tibble [500 x 24]>
9 I 206 meth2 T3 <tibble [50 x 24]>
10 J 206 meth2 T5 <tibble [16 x 24]>
11 K 212 meth2 T3 <tibble [3 x 24]>
12 L 212 meth2 T5 <tibble [3 x 24]>
13 M 212 meth2 T3 <tibble [1 x 24]>
我想将一个函数应用于融合列(嵌入的小标题)中的每个变量。融合列中的小标题包含以下列:
vtype 和 unspecific_fusion :
我想应用这条线:
x %>% group_by(vtype) %>%
summarise(n=sum(unspecific_fusion>0))
到融合列中的每个小标题(所以每行一个)。
任何想法。我尝试使用 map() 和 do() 但我总是有一个错误..
谢谢
PS:
在基础 RI 中可以使用
lapply(samplesheet$fusion,function(x){x %>%
group_by(vtype) %>%
summarise(n=sum(unspecific_fusions>0))})
但我希望有一个 dplyr 解决方案以与其使用保持一致。