假设我有一个Simulation
对象,其核心属性是一个参数字典,其形式如下:
@pytest.fixture
def param_base():
'''Dict of parameter defaults'''
return {
"fs" : 2e4,
"sweep_length" : 1,
"num_trials" : 300,
...
"pool_tau" : 1.00,
"quantal_size" : -10,
"a_tau" : (0.001,0.005)
}
我想编写一个 pytest 函数,该函数仅使用每个参数的一系列值来运行此模拟。一个结构稍有不同的字典可以封装这个想法:
@pytest.fixture
def param_ranges():
'''Dict of parameter ranges'''
p_name = [
"cav_p_open",
"num_trials",
"num_stim",
"num_cav",
"cav_i",
"num_cav_ratio",
"vesicle_prox",
]
p_sets = [
[0,0.01,0.99,1], #cav_p_open
[1,10,300], #num_trials
[1,2,5], #num_stim
[1,3,10], #num_cav
[0,1,5,10], #cav_i
[1,2], #num_cav_ratio
[0,0.01,0.25,1], #vesicle_prox
]
return dict(zip(p_name,p_sets))
重要的是,我不想运行所有这些参数的所有组合,因为模拟的数量增长得太快了。我只想一次改变一个参数,而将其他参数保留为默认值。
我目前的解决方案如下(在上面的代码之后继续):
parameter_names = [
"cav_p_open",
"num_trials",
"num_stim",
"num_cav",
"cav_i",
"num_cav_ratio",
"vesicle_prox",
]
@pytest.mark.parametrize("p_name", parameter_names)
def test_runModel_range_params(p_name,param_ranges,param_base):
alt_params = copy.deepcopy(param_base)
p_range = param_ranges[p_name]
for i in range(len(p_range)):
alt_params[p_name] = p_range[i]
SIM = utils.Simulation(params = alt_params)
效果很好,但是因为我正在遍历每个参数范围,所以我只能查看代码是否因为在特定参数的某个utils.Simulation
值处失败而失败,而不知道它具体在哪个参数上失败。
所以我认为我正在寻找的是一个嵌套版本pytest.mark.parameterize
,我可以test_runModel_range_params
在每个参数的每个范围值上运行。
有任何想法吗?优雅加分!