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在努力用 roxygen2 记录 S4 类之后,我决定退后一步,使用package.skeletonpromptClasspromptMethod.

我的问题是R CMD check,尽管我认为我已经正确记录了它们,但它仍然对“未记录的代码对象”发出警告。

我现在拥有的文件是:

测试类.R:

setClass("testClass",
        slots = c(a = "numeric"),
        prototype = prototype( a = 0 ),         
        validity = function(object) return(TRUE))

setGeneric(name = "testMethod",
            def = function(object, ...) standardGeneric("testMethod") )

setMethod(f = "testMethod", signature = "testClass",
        definition=function(object, x) 
        {
            cat("testMethod:",x,"\n")
            invisible(object)
        }
)

testClass-class.Rd

\name{testClass-class}
\Rdversion{1.1}
\docType{class}
\alias{testClass-class}
%%\alias{testMethod,testClass-method}
\title{Class \code{"testClass"}}
\description{bla bla}
\section{Objects from the Class}{bla bla}
\section{Slots}{\describe{\item{\code{a}:}{Object of class \code{"numeric"} ~~ }}}
\section{Methods}{\describe{\item{testMethod}{\code{signature(object = "testClass")}: ... }}}
\keyword{classes}

和 testMethod.Rd

\name{testMethod-methods}
\docType{methods}
\alias{testMethod-methods}
\alias{testMethod,testClass-method}
\title{ ~~ Methods for Function \code{testMethod}  ~~}
\description{blabla}
\section{Methods}{
\describe{\item{\code{signature(object = "testClass")}}{blabla}}}
\keyword{methods}

还有一个包文档文件,但我认为这里不相关。

R CMD check给出:

* checking for missing documentation entries ... WARNING
Undocumented code objects:
‘testMethod’
All user-level objects in a package should have documentation entries.
See chapter ‘Writing R documentation files’ in the ‘Writing R
Extensions’ manual.

我已经查阅了这些部分,我从中得到的是我至少需要一个别名 to generic,signature-list-method,在这种情况下,alias{testMethod,testClass-method}它是通过我调用 promtMethod 自动放入文档文件中的(我已经从类中注释掉了) .Rd 文件,因为它在那里被复制)。

我需要在 .Rd 文件中进行哪些更改才能消除此警告?

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1 回答 1

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与此同时,我发现了问题所在。看来我还需要对\alias{testMethod}.Rd 文件进行检查。然而,我觉得奇怪的是,生成的文件promptMethod没有包含这个别名。

于 2017-10-13T08:12:39.037 回答