在努力用 roxygen2 记录 S4 类之后,我决定退后一步,使用package.skeleton
、promptClass
和promptMethod
.
我的问题是R CMD check
,尽管我认为我已经正确记录了它们,但它仍然对“未记录的代码对象”发出警告。
我现在拥有的文件是:
测试类.R:
setClass("testClass",
slots = c(a = "numeric"),
prototype = prototype( a = 0 ),
validity = function(object) return(TRUE))
setGeneric(name = "testMethod",
def = function(object, ...) standardGeneric("testMethod") )
setMethod(f = "testMethod", signature = "testClass",
definition=function(object, x)
{
cat("testMethod:",x,"\n")
invisible(object)
}
)
testClass-class.Rd
\name{testClass-class}
\Rdversion{1.1}
\docType{class}
\alias{testClass-class}
%%\alias{testMethod,testClass-method}
\title{Class \code{"testClass"}}
\description{bla bla}
\section{Objects from the Class}{bla bla}
\section{Slots}{\describe{\item{\code{a}:}{Object of class \code{"numeric"} ~~ }}}
\section{Methods}{\describe{\item{testMethod}{\code{signature(object = "testClass")}: ... }}}
\keyword{classes}
和 testMethod.Rd
\name{testMethod-methods}
\docType{methods}
\alias{testMethod-methods}
\alias{testMethod,testClass-method}
\title{ ~~ Methods for Function \code{testMethod} ~~}
\description{blabla}
\section{Methods}{
\describe{\item{\code{signature(object = "testClass")}}{blabla}}}
\keyword{methods}
还有一个包文档文件,但我认为这里不相关。
R CMD check
给出:
* checking for missing documentation entries ... WARNING
Undocumented code objects:
‘testMethod’
All user-level objects in a package should have documentation entries.
See chapter ‘Writing R documentation files’ in the ‘Writing R
Extensions’ manual.
我已经查阅了这些部分,我从中得到的是我至少需要一个别名 to generic,signature-list-method
,在这种情况下,alias{testMethod,testClass-method}
它是通过我调用 promtMethod 自动放入文档文件中的(我已经从类中注释掉了) .Rd 文件,因为它在那里被复制)。
我需要在 .Rd 文件中进行哪些更改才能消除此警告?