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我正在尝试使用 rJava 包从 R 运行可运行的 JAR 文件。这个 jar 必须向/从外部文件夹写入和读取一些文件，这些文件与 jar 文件本身在同一路径中，如下所示：

mypath/myjar.jar
mypath/folder1
mypath/folder2
mypath/input_file1.txt
mypath/input_file2.txt

如果我通过在“mypath”中打开控制台并按以下方式运行 jar 来调用它，则该程序可以正常工作：

java -jar myjar.jar input_file1.txt input_file2.txt false

但是，当我尝试使用 rJava 在 R 中运行此代码时，代码会在某个时候崩溃，因为它既找不到 mypath/folder1 也找不到 mypath/folder2，即使工作目录被正确定义为“mypath”。

jinit(".",force.init=TRUE) # this starts the JVM
.jaddClassPath("myjar.jar")
jobject <- .jnew("package_name/Main")  ## call the constructor

result_java <- rJava::.jcall(obj = jobject, returnSig = "V", method = "main", c("input_file1.txt","input_file2.txt","false"))

实际上，调用了java程序，它实际上能够找到也在mypath中的输入文件，但是由于某种原因，当它尝试写入mypath中的文件夹（例如folder1和folder2）时会崩溃并出现错误：

Error executing task java.nio.file.NoSuchFileException: folder1/some_file.txt

我真的不知道发生了什么，花了几个小时。我在这里错过了一些非常明显的东西吗？

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1 回答 1

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当您使用 Java 运行代码时，您就在内部mypath和位置folder1，并且folder2对您的代码是可见的。

也许，您应该传递（作为参数）目录的位置，而不是访问folder1您的 Java 代码，您应该访问显式路径。

result_java <- 
   rJava::.jcall(
     obj = jobject, 
     returnSig = "V", 
     method = "main",
       c( 
         "input_file1.txt",
         "input_file2.txt",
         "false",
         "full_path_to_your_mypath_location"))

然后，在里面main，你可以简单地打开full_path_to_your_mypath_location/some_file.txt。当您启动 R 时，您可能不再在您的代码所在的目录中。您也可以尝试更改目录

setwd(full_path_to_your_mypath_location)
于 2017-10-02T06:48:29.637 回答