r - visNetwork with R：如何防止节点与边缘重叠

Question

我正在使用 visNetwork（用于其动态可视化）来可视化具有 47 个节点的二分图。

visNetwork(nodes, edges) %>%
     visIgraphLayout(layout = 'layout.davidson.harel')

上面的图片是它目前的样子，这是我们在尝试了一些布局（Fruchterman Reingold 等）后能想到的最好的。我遇到的问题是边缘往往很长，所以一些节点对相距很远。谁能建议一种防止节点与边缘重叠的布局？

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您的数据集的大小表明，依靠 visNetwork 来计算布局坐标而不是 igraph via 可能是可以接受的visIgraphLayout：

visNetwork(nodes, edges) %>%
    visPhysics(solver = "forceAtlas2Based",
               forceAtlas2Based = list(gravitationalConstant = -100))

为了比较，用 igraph 绘制的相同数据：

visNetwork(nodes, edges) %>%
   visIgraphLayout(layout = 'layout.davidson.harel')

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