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嗨，我正在使用 pydicom 读取 DICOM 文件

这篇文章不同于 pydicom 'Dataset' 对象没有属性 'TransferSyntaxUID'

这是我的代码

import dicom
dicom.read_file(file,force=True)

这会导致错误

        AttributeError                            Traceback (most recent call last)
    <ipython-input-32-a32aef2d2178> in <module>()
    ----> 1 dicom.read_file(raw_path + pat_lst[0] + '\\' + pat_dcm_lst[0],force=True)

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\filereader.pyc in read_file(fp, defer_size, stop_before_pixels, force)
        612     try:
        613         dataset = read_partial(fp, stop_when, defer_size=defer_size,
    --> 614                                force=force)
        615     finally:
        616         if not caller_owns_file:

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\filereader.pyc in read_partial(fileobj, stop_when, defer_size, force)
        520     if preamble:
        521         file_meta_dataset = _read_file_meta_info(fileobj)
    --> 522         transfer_syntax = file_meta_dataset.TransferSyntaxUID
        523         if transfer_syntax == dicom.UID.ImplicitVRLittleEndian:
        524             pass

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\dataset.pyc in __getattr__(self, name)
        254         if tag not in self:
        255             raise AttributeError("Dataset does not have attribute "
    --> 256                                  "'{0:s}'.".format(name))
        257         else:  # do have that dicom data_element
        258             return self[tag].value

    AttributeError: Dataset does not have attribute 'TransferSyntaxUID'.

我认为匿名时出了点问题。我想知道为什么会这样。

是否删除与 DICOM 标准相关的 TransferSyntaxUID？

而且，我可以通读MATLAB, VTK,ITK但是pydicom

所以现在我要做的是通过手动设置 TransferSyntaxUIDSimpleITK并再次通过pydicom.

我会告诉你什么时候这有效

提前致谢

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2 回答 2

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pydicom 存储库有一个更新，它可以容忍丢失的传输语法。作为下一个版本之前的解决方法，您可以修改 filereader.py 中的几行，如下所示

于 2017-09-05T03:59:35.067 回答
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根据我对 DICOM 标准的理解，Transfer Syntax UID (0002,0010) 似乎是一个强制性标签。它是一个类型 1 的标签，表明它是必需的。

虽然这是标准所说的，但即使缺少此标记，库也可能能够读取此类文件。我猜这是因为标准还定义了默认传输语法。

关于使用 SimpleITK 设置值，这绝对可以。此外，如果您需要验证您的文件是否符合标准，您可以使用 David Clunie 的dicom3tools，特别是 dciodvfy 和 dcdump。

于 2017-09-05T14:54:37.623 回答