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我有一个 sqlite 数据库,我在其中创建表并每天附加新结果。这个过程是手动的,进入 RStudio 并点击运行!

我决定使用 Jenkins 安排我的脚本,在过去的 5 个小时里我无法运行它,因为我不断收到以下错误:

Error in rsqlite_bind_rows(rs@ptr, value) : unable to open database file Calls: source ... tryCatch -> tryCatchList -> rsqlite_bind_rows -> .Call

最初认为这取决于权限,所以作为一个优秀的 unix 公民,我将我的 db 修改为 777。同样的错误!

然后(不幸的是)掉进了更新包的兔子洞:dplyr,,dbplyr-DBI阅读每个包中的所有最新更改,等等。不是幸运......

直到我dbname.sqlite3-journal在 Rstudio 文件窗口中看到一个闪烁。事实证明,这个文件是由 sqlite 为临时表和索引创建的。

显然,一旦所有事务完成并与数据库断开连接,该文件就会消失。

显然詹金斯没有修改这个文件的权限。

一种解决方法是完全写入目录,这是我目前正在做的并且正在工作的目录。

但我想知道是否有办法将这个文件发送到/var/tmp?不热衷777战略。

就像是:

con <- DBI::dbConnect(RSQLite::SQLite(), db, create = F, journal='/var/tmp')
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temp_store_directory编译指示可以提供帮助。建立连接后运行:

dbExecute(con, "PRAGMA temp_store_directory = '/var/tmp'")

并检查它现在是否适用于您的 Jenkins 安装。

于 2017-07-22T09:31:52.537 回答