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我有一些代码可以将多个(交叉验证的)模型与某些数据相匹配,如下所示。

library(datasets)
library(caret)
library(caretEnsemble)

# load data
data("iris")

# establish cross-validation structure
set.seed(32)
trainControl <- trainControl(method="repeatedcv", 
                             number=5, repeats=3, # 3x 5-fold CV
                             search="random")

algorithmList <- c('lda',         # Linear Discriminant Analysis 
                   'rpart' ,      # Classification and Regression Trees
                   'svmRadial')   # SVM with RBF Kernel

# cross-validate models from algorithmList
models <- caretList(Species~., data=iris, trControl=trainControl, methodList=algorithmList)

到目前为止,一切都很好。但是,如果我添加'gbm'到我的algorithmList,我会收到大量无关的日志消息,因为gbm似乎有一个verbose=TRUE默认的 fit 参数。

根据插入符号文档,如果我自己运行trainmethod='gbm'而不是与在 a 中训练的几个模型一起运行caretList),我可以简单地添加verbose=FALSEto train(),这将流向gbm. 但是当我在caretList.

因此,我想将verbose=FALSE(或理论上的任何其他适合参数)专门传递给caretList's中的一个特定模型methodList。我怎样才能做到这一点?

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好的,这实际上在文档中得到了很好的解决。

?caretList

包括:

tuneList:可选,caretModelSpec 对象的命名列表。这比 methodList 灵活得多,并且允许指定特定于模型的参数

我已经确认我的问题已经解决,如果不是:

algorithmList <- c('lda',         # Linear Discriminant Analysis 
                   'rpart' ,      # Classification and Regression Trees
                   'svmRadial',   # SVM with RBF Kernel
                   'gbm')         # Gradient-boosted machines

我用:

modelTypes <- list(lda      = caretModelSpec(method="lda"),
                   rpart    = caretModelSpec(method="rpart"),
                   svmRadial= caretModelSpec(method="svmRadial"),
                   gbm      = caretModelSpec(method="rf", verbose=FALSE) 

...然后该models <- caretList(...行来自:

models <- caretList(... methodList=algorithmList)

至:

models <-caretList(...  tuneList = modelTypes)
于 2017-07-18T02:25:44.010 回答