3

这是我正在使用的数据框的一小部分以供参考。我正在使用 R 中的一个数据框(MG53_HanLab),它有一个时间列,其中有几个名称为“MG53”的列,几个名称为“F2”的列和几个名称为“Iono”的列。我想比较每个时间点每个组的平均值。我知道我必须对数据进行子集化并尝试过

control <- MG53_HanLab[c(2:11)]
F2 <- MG53_HanLab[c(12:23)]
iono <- MG53_HanLab[c(24:33)]

它创建了 3 个新的数据框。

我的问题是:如何逐行比较两个数据框,看看每个表的平均值是否存在差异?

4

2 回答 2

2

rowMeans正如@Chi Pak 建议的那样,感觉更简单。

#create example data
time<-seq(1.0,6.0,.5)
A_1<-runif(11)
A_2<-runif(11)
B_1_1<-runif(11)
B_1_2<-runif(11)
B_2<-runif(11)

#create data frame
df<-data.frame(time,A_1,A_2,B_1_1,B_1_2,B_2)

#subset column groups into individual data frames using regular expression
df.a<-df[,grep('A_',colnames(df))]

#calculate rowMeans
a.mean<-rowMeans(df.a)

#repeat for other column groups
df.b<-df[,grep('B_',colnames(df))]
b.mean<-rowMeans(df.b)

#recombine to view side by side
df.mean<-data.frame(a.mean,b.mean)
于 2017-07-17T21:25:21.760 回答
1

您可以将data.table包与一些数据一起使用,将列翻转到行并再次返回。

#import library
library(data.table)

#create example data
time<-seq(1.0,6.0,.5)
A_1<-runif(11)
A_2<-runif(11)
B_1_1<-runif(11)
B_1_2<-runif(11)
B_2<-runif(11)

#instantiate data table from example data
dt <-data.table(time,A_1,A_2,B_1_1,B_1_2,B_2)

#flip all columns with underscores in name into rows using regular expression
dt.m = melt(dt,id.vars=c("time"), measure.vars=grep('_',colnames(dt)))

#remove characters after '_' to homogenize column groups
dt.m[,variable:=sub("_.*","",variable)]

#calculate the mean grouped by time and column groups
dt.mean<-dt.m[,lapply(.SD,mean),by=.(time,variable)]

#flip rows back to columns
dcast(dt.mean,time~variable,value.var = "value")
于 2017-07-17T21:11:41.220 回答