我想创建这个简单的 igraph 图：
library(igraph)
mydata <- data.table(from=c("John", "John", "Jim"),to=c("John", "Jim", "Jack"))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=T)
plot(mygraph, vertex.label.dist=2)
带图解
library(DiagrammeR)
mygraph2 <- from_igraph(mygraph)
grViz(mygraph2)
产生此错误
file.exists（图表）中的错误：无效的“文件”参数
我也试过
grViz(readLines(mygraph2))
和其他组合或命令 plot() 但我找不到正确的方法。
我该怎么做？
我已经打开了一个新问题，直接使用 DiagrammeR 获得相同的结果，没有 igraph：
似乎有几件事正在发生。
library(igraph)
library(DiagrammeR)
mydata <- data.table(from=c("John", "John", "Jim"),to=c("John", "Jim", "Jack"))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=TRUE)
以下代码引发警告
mygraph2 <- from_igraph(mygraph)
警告消息：1：在 data.frame(from = as.integer(igraph::ends(igraph, igraph::E(igraph))[, : 强制引入的 NA
如果您查看mygraph2没有节点或边缘信息，它不会呈现：render_graph(mygraph2)。但是警告信息很丰富，因为它指向代码行（as.integer(ends(mygraph, E(mygraph), names=TRUE))：也许我们想要 names=FALSE），所以尝试删除 names ，但设置标签
V(mygraph)$label = V(mygraph)$name
V(mygraph)$name = factor(V(mygraph)$name, levels=as.character(V(mygraph)$name))
没有警告和渲染
mygraph2 <- from_igraph(mygraph)
render_graph(mygraph2)
如果您想查看dot可以使用的代码generate_dot，然后将其传递给grViz，那么这就是render_graph正在做的事情。
grViz(generate_dot(mygraph2))
您的过程中有两个问题。
第一个在命令中from_igraph。我不确定，可能是包中的错误，可能是我的设置有问题，但我无法使用它来获得所需的结果。以下适用于我的机器。
mygraph3 <- from_adj_matrix(as.matrix(get.adjacency(mygraph)), mode = "directed")
然后你需要render_graph或类似的东西来获取你的图表，grViz是用于图形的字符串表示，而不是用于图形本身。
render_graph(mygraph3)