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我正在尝试使用 seaborn 绘制热图并将其导出到 pgf 以便在 Latex 中导入。这或多或少有效,唯一困扰我的是颜色栏导出为额外的 png。

因此,如果我将导出运行到 pgf,我会得到以下信息:

  • 测试.pgf
  • 测试-img0.png

这绝对是不可取的,因为 png 不能很好地缩放。一些MWE:

import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import seaborn as sns

df = pd.DataFrame.from_csv("test.csv", sep=',')

sns.set('paper', 'white', rc={'font.size': 10, 'axes.labelsize': 10, 'legend.fontsize': 8, 'axes.titlesize': 10,
                              'xtick.labelsize': 8,
                              'ytick.labelsize': 8, "pgf.rcfonts": False})
plt.rc('font', **{'family': 'serif', 'serif': ['Times']})
plt.rc('text', usetex=True)
fig = plt.figure()
ax = sns.heatmap(df, linewidths=.5)
fig.savefig('test.pdf')
fig.savefig('test.pgf')

以及 test.csv 的内容:

0,1,2,3,4
1,1,1,1,1
2,2,2,2,2
3,3,3,3,3

有没有人有解决方案将颜色条包含到 pgf 输出中?

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1 回答 1

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我在导出到 pgf/tikz 的库中发现了一些特性。

首先,在 中matplotlib,quadmesh(即热图)正确导出到 pgf,但颜色条导出为 png(操作遇到的内容)。

matplotlib2tikz我在图书馆尝试了同样的事情。在这种情况下,quadmesh 导出为 png,但可以正确导出颜色图。但是,如果您抑制热图,例如通过将颜色图绘制到单独的Axes并清除热图轴,则颜色栏将导出为 png。

因此,如果您结合两个导出的输出,您可以同时拥有它们。

热图:

import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import seaborn as sns
df = pd.DataFrame.from_csv("test.csv", sep=',')

sns.set('paper', 'white',
        rc={'font.size': 10, 'axes.labelsize': 10,
            'legend.fontsize': 8, 'axes.titlesize': 10,
            'xtick.labelsize': 8,'ytick.labelsize': 8, 
            "pgf.rcfonts": False,
           })
plt.rc('font', **{'family': 'serif', 'serif': ['Times']})
plt.rc('text', usetex=True)
fig, ax = plt.subplots(figsize=(6,6))
ax = sns.heatmap(df, linewidths=.5, ax=ax, cbar=False)
fig.savefig('heatmap_nocbar.pgf')

请注意,我用cbar=False

然后获取颜色条:

import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import seaborn as sns
from matplotlib2tikz import save as tikz_save

df = pd.DataFrame.from_csv("test.csv", sep=',')

sns.set('paper', 'white',
        rc={'font.size': 10, 'axes.labelsize': 10,
            'legend.fontsize': 8, 'axes.titlesize': 10,
            'xtick.labelsize': 8,'ytick.labelsize': 8, 
            "pgf.rcfonts": False,
           })
plt.rc('font', **{'family': 'serif', 'serif': ['Times']})
plt.rc('text', usetex=True)
fig, ax = plt.subplots()
ax = sns.heatmap(df, linewidths=.5, ax=ax, )
tikz_save('colormap.tex', figure=fig, strict=True)

该解决方案现在需要一些肮脏的工作。我知道这确实不是一个好习惯,但这是我能找到的唯一方法。

colormap.tex文件中,您需要删除除颜色图所需的行之外的所有行。

的开端colormap.tex

\begin{tikzpicture}

\begin{axis}[

... % definition of axis: delete these lines

colorbar,
colormap={mymap}{[1pt]
...

所以你得到这个:

\begin{tikzpicture}

\begin{axis}[
hide axis,
colorbar,
colormap={mymap}{[1pt]
...

在文件末尾,删除方括号和 之间的所有内容\end{axis}

]
... %delete these lines
\end{axis}

文件中的这种更改可以自动化,我在github上的代码中包含了一个示例

在您的主 tex 文件中,您可以添加这两个数字

\input{heatmap_nocbar.pgf}
\input{colorbar.tex}

如果您想要一个完整的工作示例和完整的输出,我已将此答案中的所有内容放在github 上

这对你来说可能远非一个完美的答案,但我缺乏 python 技能来深入研究后端matplotlibmatplotlib2tikz给出一个更好的例子。

于 2017-06-20T22:37:11.700 回答