我即将使用 Reticulate 包在 R 中创建一个 python 接口。为了访问 R 中的 python 函数,需要安装相应的 python 包。
我想到了两个问题:
1)如果使用reticulate包,需要安装Anaconda包吗?还是只安装 python 包就足够了?
2) 是否可以在 R 中安装 python 包,类似于 install.packages("r_package")?
有没有人有这个话题的经验?提前致谢!
我即将使用 Reticulate 包在 R 中创建一个 python 接口。为了访问 R 中的 python 函数,需要安装相应的 python 包。
我想到了两个问题:
1)如果使用reticulate包,需要安装Anaconda包吗?还是只安装 python 包就足够了?
2) 是否可以在 R 中安装 python 包,类似于 install.packages("r_package")?
有没有人有这个话题的经验?提前致谢!
1) R 包reticulate
可以使用默认的 python 或使用Anaconda2
or Anaconda3
。如果你想让 Anaconda 与 R 一起工作,你必须先安装 Anaconda。安装后,您调用library(reticulate)
,然后运行py_config()
or reticulate::py_discover_config()
,这将为您提供 Python 安装使用的路径和环境列表。然后,一旦你知道了 Python 路径,你就可以添加这样的一行use_python("/opt/miniconda2/bin/python")
,library(reticulate)
然后你就开始做生意了。
2) 要安装 Python 包以便 R(或网状)可以看到它们,您必须从终端或控制台将它们作为常规 Python 包安装;不是R。例如:conda install numpy
安装numpy,或者conda install scipy
安装scipy,等等。
我只是在 Docker 容器中做这一切rocker/rstudio
。在标准操作系统中应该更容易。
这是分步说明:rstudio reticulate
干杯!
如果您需要特定版本的 Python 模块,请放在==
模块名称之后,例如,以下将使用 pip 安装 3 个模块的特定版本:
reticulate::conda_install(c("PyMuPDF==1.14.20", "PyPDF2==1.26.0", "reportlab==3.5.23"),
envname = "myenv", pip = TRUE)