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如果我在没有滑动窗口的情况下为 AVGQUAL:20 发出命令,它会为滑动窗口设置任何默认值吗?

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如果您查看 trimmmomatic 网站http://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomatic,您会在那里找到手册。

在手册中它对 AVGQUAL 说:AVGQUAL: Drop the read if the average quality is below the specified level

因此不需要窗口,因为这一步总结了所有质量,除以长度并检查是否达到阈值,然后丢弃或保留读取。

于 2017-06-16T07:04:24.490 回答