我使用 FactorMineR 包构建了一个简单的应用程序,根据所选变量进行 MCA 分析和聚类。
该应用程序在我的本地设备上运行良好,但它没有在 shinyapps.io 服务器上显示任何图(基本图和 ggplots)。我检查了包裹,本地和远程它们是相同的。我还检查了 FactoMineR pcg 中的 MCA() 函数是否可以通过提取一些结果并将它们呈现为表格来产生积极的结果。所以只有绘图的问题。我一直在尝试解决它两天,但没有任何帮助,所以我向您寻求任何建议。
这是应用程序的链接:https ://mikolajm.shinyapps.io/MCA_test/
和一个可重复的例子
library(shiny)
library(FactoMineR)
library(cluster)
library(ggplot2)
data(tea)
ui <- fluidPage(
# Application title
titlePanel("MCA"),
textOutput("packages"),br(),
tableOutput("table"),br(),
fluidRow(
column(4, checkboxGroupInput("Variables", "Select variables:",
names(tea), selected=c("breakfast", "tea.time"))),
column(4, plotOutput("plot")), column(4, plotOutput("plot1"))),
fluidRow(column(12, plotOutput("dendro", height = "700px", width="1200px"))
)
)
server <- function(input, output) {
## packages checking
output$packages <- renderText({.packages()})
tea_selected <- reactive({
tea[, input$Variables]
})
## table with some results from MCA() fun
output$table <- renderTable({
tea.mca <- MCA(tea_selected(), ncp=9)
tea.mca$eig[1:5,]
})
## mca1
output$plot <- renderPlot({
library(FactoMineR)
par(mfrow=c(2,2))
tea.mca <- MCA(tea_selected(), ncp=9)
})
## mca with ggplot
output$plot1 <- renderPlot({
tea.mca <- MCA(tea_selected(), ncp=9)
tea_vars_df <- data.frame(tea.mca$var$eta2, Variable =names(tea_selected()))
library(ggplot2)
pp <- ggplot(data=tea_vars_df, aes(x=Dim.1, y=Dim.2, label=Variable))+
geom_hline(yintercept = 0, colour = "gray70") +
geom_vline(xintercept = 0, colour = "gray70") +
geom_point()+
geom_text() +
ggtitle("MCA plot of variables ")+
theme_bw()
pp
})
### dendro
output$dendro <- renderPlot({
library(FactoMineR)
library(cluster)
tea.mca <- MCA(tea_selected(), ncp=9)
classif <- agnes(tea.mca$ind$coord,method="ward")
plot(classif,main="Dendrogram",ask=F,which.plots=2)
})
}
# Run the application
shinyApp(ui = ui, server = server)