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我正在尝试对程序的输入文件使用进程替换，但它不起作用。是因为某些程序不允许进程替换输入文件吗？

以下不起作用：

bash -c "cat meaningless_name"
    >sequence1
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
    >sequence2
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
bash -c "clustalw -align -infile=<(cat meaningless_name) -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Less verbose output, finishing with:
    No sequences in file. No alignment!

但以下控件确实有效：

bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]
bash -c "cat <(cat meaningless_name) > meaningless_name2"
diff meaningless_name meaningless_name2
    (No output: the two files are the same)
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name2 -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]

这表明进程替换本身有效，但 clustalw 程序本身不喜欢进程替换 - 可能是因为它创建了一个非标准文件，或者创建了具有不寻常文件名的文件。

程序不接受进程替换是否很常见？我将如何检查这是否是问题所在？

我在 Ubuntu 9.10 上运行 GNU bash 版本 4.0.33(1)-release (x86_64-pc-linux-gnu)。Clustalw 是 2.0.10 版。

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进程替换创建一个命名管道。您无法搜索命名管道。

于 2010-11-25T15:07:42.973 回答
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是的。我在其他程序中注意到了同样的事情。例如，它在 emacs 中也不起作用。它给出“文件存在但无法读取”。对我来说，这绝对是一个特殊的文件/proc/self/fd/some_number。并且在默认设置下，它也不能可靠地工作。lessmost

对于大多数：

most <(/bin/echo 'abcdef')

更短的不显示任何内容。较长的值会截断开头。 less显然有效，但前提是您指定-f.

我发现 zsh=在实践中更有用。它在语法上是相同的，除了=代替<. 但它只是创建一个临时文件，因此支持不依赖于程序。

编辑：

我发现 zsh 用于TMPPREFIX选择临时文件名。所以即使你不希望你的真实/tmp存在tmpfs，你也可以为 zsh 挂载一个。

于 2010-11-25T06:05:06.477 回答