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我有兴趣以热图风格呈现医院指标。我使用的是闪亮的,所以我喜欢交互式d3heatmap()绘图的外观和感觉(但对替代方案持开放态度)。

例如,假设我有 4 家医院和 5 个指标。我想绘制每个医院在每个指标上的得分,但是,着色不应取决于指标的实际值,而应取决于单独进行的统计测试(80% 的值可能表示 4/5,但也可能表示 800/ 1000,这在估计的精度方面非常不同),它具有以下分组:

  • 高于平均水平
  • 与平均值没有差异
  • 低于平均值

示例数据(请注意,实际数字没有意义):

df <- data.frame(Hospital=rep(LETTERS[10:13], each=5), 
                 Indicator=rep(LETTERS[1:5], 4), 
                 Value=sample(1:10, 20, replace=T), 
                 Conclusion=sample(c("above", "not different", "below"), 20, replace=T))
df$colour[df$Conclusion == "above"] <- "green"
df$colour[df$Conclusion == "not different"] <- "grey"
df$colour[df$Conclusion == "below"] <- "red"
df

做一个d3heatmap我得到:

d1 <- dcast(df, Hospital ~ Indicator, value.var = "Value")
row.names(d1) <- paste0("hosp",d1[[1]])
d3heatmap(d1[-1], dendrogram = "none")

(屏幕截图) 在此处输入图像描述 ,当我将鼠标悬停在它上面时,我得到了我感兴趣的指标的实际分数。但是,着色现在基于指标的实际分数,而不是我的数据框中的颜色。

如何使用示例数据框中的颜色,同时在将鼠标悬停在绘图上时保留可视化指标值的选项?

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2 回答 2

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您可以简单地使用数字来编码颜色,然后使用colors参数传递颜色来解码:

df$colour[df$Conclusion == "above"] <- 1         #green
df$colour[df$Conclusion == "not different"] <- 2 #grey
df$colour[df$Conclusion == "below"] <- 3         #red

d1 <- dcast(df, Hospital ~ Indicator, value.var = "colour")

d3heatmap(d1[-1], dendrogram = "none", colors=c("green", "grey","red"))

在此处输入图像描述

于 2017-02-17T00:23:21.013 回答
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谢谢休伯特!我扩展它以获得确切的答案:

# Cast to get the matric with the values to display when hovering
d1 <- dcast(df, Hospital ~ Indicator, value.var = "Value")
row.names(d1) <- paste0("hosp",d1[[1]])


# Cast to get the matrix with the colours to display
df$colour[df$Conclusion == "above"] <- 1         #green
df$colour[df$Conclusion == "not different"] <- 2 #grey
df$colour[df$Conclusion == "below"] <- 3         #red
df$colour <- as.numeric(df$colour)
d2 <- dcast(df, Hospital ~ Indicator, value.var = "colour")


# Plot heatmap using colours, and refer to the value-matrix in the 'cellnote'
d3heatmap(d2[-1], dendrogram = "none", colors=c("blue", "grey","red"), cellnote = d1[-1])

附加问题:当(在我的情况下)指标名称很长时,有人知道如何扩大边距吗?

于 2017-02-17T02:47:01.107 回答