ase - 如何使用 ase 计算键长？

Question

我知道一个函数 ase.Atoms.get_distance 但我不知道如何使用它。

我可以使用其他功能以及如何使用它吗？

Answer 1

如果mol是一个ase.Atoms对象，请使用：

mol.get_distance(atom_index1, atom_index2)

Answer 2

如果您知道atom对象中atoms对象的数量，您可能可以执行 atom[1].get_position 和 atom[2].get_position 之类的操作并减去向量。