4

我一直在尝试将字符串标签编码为单热编码时遇到内存问题。大约有 500 万行和大约 10000 个不同的标签。我尝试了以下方法，但不断收到内存错误：

from sklearn import preprocessing
lb = preprocessing.LabelBinarizer()
label_fitter = lb.fit(y)
y = label_fitter.transform(y)

我也尝试过这样的事情：

import numpy as np

def one_hot_encoding(y):
    unique_values = set(y)
    label_length = len(unique_values)
    enu_uniq = zip(unique_values , range(len(unique_values)))
    dict1 = dict(enu_uniq)
    values = []
    for i in y:
        temp = np.zeros((label_length,), dtype="float32")
        if i in dict1:
            temp[dict1[i]] = 1.0
        values.append(temp)
    return np.array(values)

仍然出现内存错误。任何提示？堆栈中有一些人在问同样的问题，但没有答案似乎有点有用。

4

2 回答 2

3

在提出问题时这可能不可用，但LabelBinarizer需要一个sparse_output参数。

from sklearn.preprocessing import LabelBinarizer

lb = LabelBinarizer(sparse_output=True)
于 2018-03-21T09:34:29.970 回答
3

您的主要问题似乎是二值化y不适合您的记忆。您可以使用稀疏数组来避免这种情况。

>>> import numpy as np
>>> from scipy.sparse import csc_matrix
>>> y = np.random.randint(0, 10000, size=5000000) # 5M random integers [0,10K)

您可以将这些标签y转换为5M x 10K稀疏矩阵，如下所示：

>>> dtype = np.uint8 # change to np.bool if you want boolean or other data type
>>> rows = np.arange(y.size) # each of the elements of `y` is a row itself
>>> cols = y # `y` indicates the column that is going to be flagged
>>> data = np.ones(y.size, dtype=dtype) # Set to `1` each (row,column) pair
>>> ynew = csc_matrix((data, (rows, cols)), shape=(y.size, y.max()+1), dtype=dtype)

ynew然后是一个稀疏矩阵，其中每一行都充满了零，除了一个条目：

>>> ynew
<5000000x10000 sparse matrix of type '<type 'numpy.uint8'>'
     with 5000000 stored elements in Compressed Sparse Column format>

您将不得不调整您的代码以学习如何处理稀疏矩阵，但这可能是您拥有的最佳选择。此外，您可以从稀疏矩阵中恢复完整的行或列：

>>> row0 = ynew[0].toarray() # row0 is a standard numpy array

对于字符串标签或任意数据类型的标签：

>>> y = ['aaa' + str(i) for i in np.random.randint(0, 10000, size=5000000)] # e.g. 'aaa9937'

首先提取从标签到整数的映射：

>>> labels = np.unique(y) # List of unique labels
>>> mapping = {u:i for i,u in enumerate(labels)}
>>> inv_mapping = {i:u for i,u in enumerate(labels)} # Only needed if you want to recover original labels at some point

上面mapping将每个标签映射到一个整数（基于它们存储在唯一集合中的顺序labels）。

然后再次创建稀疏矩阵：

>>> N, M = len(y), labels.size
>>> dtype = np.uint8 # change np.bool if you want boolean
>>> rows = np.arange(N)
>>> cols = [mapping[i] for i in y]
>>> data = np.ones(N, dtype=dtype)
>>> ynew = csc_matrix((data, (rows, cols)), shape=(N, M), dtype=dtype)

如果将来您想知道label X映射到哪些原始标签，您可以创建（尽管不是必需的）逆映射：

>>> inv_mapping = {i:u for i,u in enumerate(labels)}
>>> inv_mapping[10] # ---> something like 'aaaXXX'
于 2016-12-09T12:54:11.017 回答