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我正在使用 openCPU 创建一个 API 来估计 rstan 中非常基本的模型。

我已经验证,当从普通的 R 控制台会话调用时,我的函数在我的环境中工作,而不是从 openCPU 调用。

但是通过openCPU调用时,响应如下:

cannot open the connection

In call:
file(con, "r")

通过在 rstan 的源代码中插入检查点,我将其追溯到 R/cxxfunplus.R 中的一个调用(此处链接到 github 上的行):

dso <- new('cxxdso', sig = sig, dso_saved = save_dso, 
             dso_filename = dso_filename, 
             modulename = module_name, 
             system = R.version$system, 
             cxxflags = get_makefile_flags("CXXFLAGS"), 
             .CXXDSOMISC = new.env(parent = emptyenv()))

此调用中的什么试图读取可能失败的连接?

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想通了 -rstan::get_makefile_txt在 openCPU 下运行时,正在寻找的两个 makefile 之一不存在。该文件是 /usr/share/R/share/make。

幸运的是,第一个 makefile 确实存在并且足够了,因此可以通过跳过第二个 makefile 并仅读取第一个来纠正此问题。

在最后一行之前rstan::get_makefile_text,我插入了以下内容:

makefiles <- makefiles[file.exists(makefiles)]
于 2016-11-10T17:13:03.357 回答