0

我在一个文件夹中有许多 NCDF 文件。我尝试使用rasterncdf4包将它们提取到光栅砖中。如果我分别提取每个 NCDF 文件,它就可以工作。但是,我尝试使用 for 循环提取所有文件,然后它给了我错误。

R<-list.files("D:/Results/TimeSeries/NETCDF/")
r<-brick(paste0("D:/Results/TimeSeries/NETCDF/",R[[1]]),varname="T_min")

for(i in 2:length(R)){
r1<-brick(paste0("D:/Results/TimeSeries/NETCDF/",R[[i]]),varname="T_min")
r<-brick(r,r1)
}

as.integer(nl) 中的错误:无法将类型“S4”强制转换为“整数”类型的向量

如果我分别看,r它们r1似乎具有相同的程度,并且都是光栅砖类型:

> r
class       : RasterBrick 
dimensions  : 81, 81, 6561, 122  (nrow, ncol, ncell, nlayers)
resolution  : 1, 1  (x, y)
extent      : 0.5, 81.5, 0.5, 81.5  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : NA 
data source : D:\Results\TimeSeries\NETCDF\timeseries_1km_2026.nc 
names       : X0026.05.02, X0026.05.03, X0026.05.04, X0026.05.05, X0026.05.06, X0026.05.07, X0026.05.08, X0026.05.09, X0026.05.10, X0026.05.11, X0026.05.12, X0026.05.13, X0026.05.14, X0026.05.15, X0026.05.16, ... 
Date        : 0026-05-02, 0026-08-31 (min, max)
varname     : T_min 

> r1
class       : RasterBrick 
dimensions  : 81, 81, 6561, 122  (nrow, ncol, ncell, nlayers)
resolution  : 1, 1  (x, y)
extent      : 0.5, 81.5, 0.5, 81.5  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : NA 
data source : D:\Results\TimeSeries\NETCDF\timeseries_1km_2027.nc 
names       : X0027.05.02, X0027.05.03, X0027.05.04, X0027.05.05, X0027.05.06, X0027.05.07, X0027.05.08, X0027.05.09, X0027.05.10, X0027.05.11, X0027.05.12, X0027.05.13, X0027.05.14, X0027.05.15, X0027.05.16, ... 
Date        : 0027-05-02, 0027-08-31 (min, max)
varname     : T_min 

请帮忙。

4

1 回答 1

0

不用循环,raster是矢量化的,试试

p <- "D:/Results/TimeSeries/NETCDF"
R <- list.files(p, pattern = "nc$")

r <- raster::stack(file.path(p, R), varname = "T_min")

如果你确实需要循环,我会这样做:

r <- raster::stack(lapply(file.path(p, R), raster::raster, varname = "T_min"))

编辑:用 raster::stack 替换 raster::raster。

还要注意 的使用file.path,以及内部可用的设施list.files。(为文件路径粘贴文本可能会出现问题,并且比使用可用函数更复杂)。

于 2016-11-03T11:47:16.360 回答